SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 1

同義遺伝子名

CRACD1, SWI/SNF complex 60 kDa subunit, 60 kDa BRG-1/Brm-associated factor subunit A, SMARCD1, BRG1-associated factor 60A, BAF60A

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:40.30

小脳:63

脳幹:-

脳梁:-

松果体:296.70

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:-

目:58.80

動脈:30

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:141.70

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:64

皮膚:24

GeneChip

大脳:5.18

小脳:5.34

脳幹:5.22

脳梁:5.21

松果体:-

末梢神経:5.23

脊柱:5.14

網膜:-

目:-

動脈:5.17

静脈:5.20

リンパ節:5.13

末梢血:-

脾臓:5.03

胸腺:5.12

骨髄:5.06

脂肪:5.40

骨:-

皮膚:5.16

CAGE

大脳:3.40

小脳:-

脳幹:3.20

脳梁:3.80

松果体:3.36

末梢神経:-

脊柱:3.43

網膜:-

目:-

動脈:3.37

静脈:3.75

リンパ節:3.51

末梢血:-

脾臓:3.72

胸腺:4.36

骨髄:-

脂肪:3.45

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.95

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.78

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.80

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:21.90

前立腺:11.30

卵巣:37.30

精巣:43.30

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:64.80

結腸:25.40

肝臓:-

肺:24.40

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:53.30

乳腺:46.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.06

胎盤:5.12

前立腺:4.62

卵巣:5

精巣:5.04

心臓:5.08

骨格筋:5.16

食道:5.09

胃:4.86

腸:4.98

結腸:5.19

肝臓:5.07

肺:5.17

膀胱:-

腎臓:5.12

下垂体:5.17

甲状腺:4.96

副腎:5.01

膵臓:4.75

乳腺:5.14

唾液腺:5.10

CAGE

子宮:3.44

胎盤:3.50

前立腺:3.28

卵巣:3.55

精巣:3.87

心臓:3.19

骨格筋:3.13

食道:3.26

胃:-

腸:3.54

結腸:3.41

肝臓:3.13

肺:3.33

膀胱:3.10

腎臓:3.57

下垂体:3.05

甲状腺:3.48

副腎:-

膵臓:3.16

乳腺:3.27

唾液腺:3.24

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.54

卵巣:3.93

精巣:3.65

心臓:2.33

骨格筋:2.54

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.51

肝臓:2.40

肺:2.77

膀胱:-

腎臓:3.48

下垂体:-

甲状腺:3.77

副腎:3.87

膵臓:-

乳腺:3.40

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003076
Gene ID	6602
Unigene ID	Hs.79335
Probe set ID	203183_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000066117
GTEx ID	ENSG00000066117

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_031842
ラット[1]	NM_001108752

染色体

12q13.12 [50,478,755 - 50,494,495]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019835	SWIB domain
IPR003121	SWIB/MDM2 domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0048096	chromatin-mediated maintenance of transcription
GO:0007399	nervous system development
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0016514

SWI/SNF complex

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0032947	protein complex scaffold
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function