PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast)

同義遺伝子名

HPRP4P, Prp4p, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, PRP4, HPRP4, PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast), U4/U6 snRNP 60 kDa protein, WD splicing factor Prp4, PRPF4, hPrp4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:13

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:23.50

動脈:60

静脈:133.30

リンパ節:40.40

末梢血:72.90

脾臓:-

胸腺:25.80

骨髄:59

脂肪:80.70

骨:12.80

皮膚:96

GeneChip

大脳:6.02

小脳:6.10

脳幹:6.05

脳梁:5.81

松果体:-

末梢神経:6.16

脊柱:5.96

網膜:-

目:-

動脈:5.64

静脈:5.71

リンパ節:6.15

末梢血:-

脾臓:6.43

胸腺:6.84

骨髄:6.13

脂肪:5.73

骨:-

皮膚:6.17

CAGE

大脳:3.02

小脳:-

脳幹:2.63

脳梁:2.77

松果体:3.56

末梢神経:-

脊柱:3.01

網膜:-

目:-

動脈:2.86

静脈:2.90

リンパ節:3.02

末梢血:-

脾臓:2.95

胸腺:2.98

骨髄:-

脂肪:2.75

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.54

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:18.20

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:26

心臓:38.30

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:21.10

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:695.90

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:37.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.44

胎盤:5.57

前立腺:6.97

卵巣:6.78

精巣:6.50

心臓:5.89

骨格筋:5.69

食道:6.34

胃:6.11

腸:5.99

結腸:6.07

肝臓:6.13

肺:6.04

膀胱:-

腎臓:6.39

下垂体:6

甲状腺:6

副腎:6.15

膵臓:6.39

乳腺:6.56

唾液腺:6.43

CAGE

子宮:2.90

胎盤:2.83

前立腺:2.89

卵巣:2.97

精巣:2.89

心臓:2.99

骨格筋:3.14

食道:2.77

胃:-

腸:2.55

結腸:2.64

肝臓:2.81

肺:2.77

膀胱:2.95

腎臓:2.80

下垂体:3.04

甲状腺:2.64

副腎:-

膵臓:3.06

乳腺:3.12

唾液腺:3.01

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.97

卵巣:0.00

精巣:1.91

心臓:1.19

骨格筋:1.18

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.36

肝臓:1.34

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:1.03

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.40

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004697
Gene ID	9128
Unigene ID	Hs.530284
Probe set ID	209162_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000136875
GTEx ID	ENSG00000136875

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_027297
ラット[1]	NM_001106659

染色体

9q32 [116,037,623 - 116,055,466]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR014906	Pre-mRNA processing factor 4 (PRP4) like
IPR003648	Splicing factor motif
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006396	RNA processing
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0015030	Cajal body
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0071001	U4/U6 snRNP

Molecular Function

GO:0005515

protein binding

PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function