SET domain, bifurcated 1

同義遺伝子名

H3-K9-HMTase 4, SET domain, bifurcated 1, Histone H3-K9 methyltransferase 4, SET domain bifurcated 1, ERG-associated protein with SET domain, ESET, KG1T, KIAA0067, SETDB1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:74.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:320.80

松果体:-

末梢神経:184

脊柱:-

網膜:-

目:99.90

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:121.30

末梢血:72.90

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:161.30

骨:51.20

皮膚:62.40

GeneChip

大脳:5.31

小脳:5.37

脳幹:5.27

脳梁:5.44

松果体:-

末梢神経:5.32

脊柱:5.29

網膜:-

目:-

動脈:5.46

静脈:5.51

リンパ節:5.45

末梢血:-

脾臓:5.55

胸腺:5.27

骨髄:5.58

脂肪:5.60

骨:-

皮膚:5.61

CAGE

大脳:2.81

小脳:-

脳幹:2.94

脳梁:3.46

松果体:3.04

末梢神経:-

脊柱:2.99

網膜:-

目:-

動脈:2.86

静脈:3.12

リンパ節:3.25

末梢血:-

脾臓:3.11

胸腺:3.25

骨髄:-

脂肪:2.89

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.87

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.40

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.55

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:127.60

胎盤:87.40

前立腺:45.10

卵巣:37.30

精巣:38.90

心臓:114.90

骨格筋:-

食道:342.80

胃:42.50

腸:-

結腸:93.30

肝臓:126.70

肺:44

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:152.40

膵臓:160

乳腺:148.70

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.55

胎盤:5.46

前立腺:5.29

卵巣:5.56

精巣:5.37

心臓:5.21

骨格筋:5.44

食道:5.39

胃:5.37

腸:5.62

結腸:5.43

肝臓:5.54

肺:5.46

膀胱:-

腎臓:5.35

下垂体:5.59

甲状腺:5.37

副腎:5.42

膵臓:6.01

乳腺:5.35

唾液腺:5.50

CAGE

子宮:3.33

胎盤:2.99

前立腺:2.98

卵巣:3.00

精巣:3.90

心臓:2.53

骨格筋:2.52

食道:2.84

胃:-

腸:3.02

結腸:3.13

肝臓:2.14

肺:3.03

膀胱:2.99

腎臓:2.78

下垂体:2.76

甲状腺:2.90

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:2.69

唾液腺:2.50

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.36

卵巣:3.23

精巣:4.12

心臓:1.62

骨格筋:1.45

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.25

肝臓:1.97

肺:0.98

膀胱:-

腎臓:2.46

下垂体:-

甲状腺:3.13

副腎:3.43

膵臓:-

乳腺:2.63

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001145415
Gene ID	9869
Unigene ID	Hs.643565
Probe set ID	214197_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000143379
GTEx ID	ENSG00000143379

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_001163641, NM_001163642, NM_018877
ラット[6]	NM_001163641, NM_001163642, NM_018877

染色体

1q21.3 [150,898,739 - 150,937,213]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016177	DNA-binding, integrase-type
IPR001739	Methyl-CpG DNA binding
IPR007728	Pre-SET domain
IPR003606	Pre-SET zinc-binding sub-group
IPR002999	Tudor domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0060348	bone development
GO:0001833	inner cell mass cell proliferation
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0018024	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

SET domain, bifurcated 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function