shroom family member 2

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同義遺伝子名

4832440C16, Shroom2, Apxl, shroom family member 2, C630003H05Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:118.10 小脳:55.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:515.60 末梢神経:19.10 脊柱:141.90 網膜:32.10 目:60.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:9.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:23.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.35 小脳:- 脳幹:4.34 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.56 網膜:- 目:- 動脈:2.02 静脈:- リンパ節:1.41 末梢血:- 脾臓:1.12 胸腺:1.17 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.30 皮膚:2.46
RNA-seq 大脳:2.29 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:46 精巣:7.40 心臓:- 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:18.10        肺:-    膀胱:- 腎臓:48.40 下垂体:- 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.80 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.03 胎盤:3.09 前立腺:2.88 卵巣:3.00 精巣:1.18 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.44 腸:2.78 結腸:2.73     肝臓:3.28    肺:2.87 膀胱:2.37 腎臓:- 下垂体:2.53 甲状腺:- 副腎:2.22 膵臓:3.10 乳腺:2.69 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:0.76 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.31        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172441
Gene ID 110380
Unigene ID Mm.40796
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000045180

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001649
ラット[1]  NM_001047893

染色体

XF3  [149,044,052  -  149,204,008]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8661129
8889548
9503026
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
14610273
16141072
16141073
16684770
16987870
17666436
17967808
18799693
21248203
21267068
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051017  actin filament bundle formation
GO:0045176  apical protein localization
GO:0007420  brain development
GO:0043010  camera-type eye development
GO:0048593  camera-type eye morphogenesis
GO:0016477  cell migration
GO:0000902  cell morphogenesis
GO:0045217  cell-cell junction maintenance
GO:0043482  cellular pigment accumulation
GO:0043583  ear development
GO:0032401  establishment of melanosome localization
GO:0008057  eye pigment granule organization
GO:0002089  lens morphogenesis in camera-type eye
GO:0032438  melanosome organization
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0030835  negative regulation of actin filament depolymerization

Cellular Component

GO:0043296  apical junction complex
GO:0016324  apical plasma membrane
GO:0005938  cell cortex
GO:0030054  cell junction
GO:0043025  cell soma
GO:0005913  cell-cell adherens junction
GO:0005911  cell-cell junction
GO:0030864  cortical actin cytoskeleton
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0031941  filamentous actin
GO:0016020  membrane
GO:0005874  microtubule
GO:0005886  plasma membrane
GO:0005923  tight junction

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0051015  actin filament binding
GO:0008013  beta-catenin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019904  protein domain specific binding