ligatin

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同義遺伝子名

D1Ertd5e, Lgtn, ligatin, Ligatin

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:92

小脳:755.20

脳幹:158.90

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:248.40

脊柱:662

網膜:128.60

目:45.60

動脈:421.90

静脈:-

リンパ節:550.90

末梢血:57.50

脾臓:131.70

胸腺:168

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.50

皮膚:158.40

GeneChip

大脳:7.39

小脳:7.10

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:7.37

脊柱:7.29

網膜:7.35

目:7.95

動脈:-

静脈:7.83

リンパ節:7.79

末梢血:-

脾臓:7.64

胸腺:-

骨髄:8.17

脂肪:7.88

骨:7.88

皮膚:8.22

CAGE

大脳:3.39

小脳:-

脳幹:3.24

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.09

網膜:-

目:-

動脈:3.05

静脈:-

リンパ節:3.24

末梢血:-

脾臓:3.21

胸腺:3.08

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.18

皮膚:3.20

RNA-seq

大脳:4.49

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:130.90

胎盤:124.30

前立腺:-

卵巣:103.40

精巣:59.10

心臓:111.60

骨格筋:-

食道:-

胃:327.30

腸:37

結腸:70.50

肝臓:135.80

肺:281.20

膀胱:330.90

腎臓:80.60

下垂体:142.10

甲状腺:-

副腎:2122.20

膵臓:46.90

乳腺:117.50

唾液腺:54

GeneChip

子宮:8.02

胎盤:7.99

前立腺:8.47

卵巣:7.85

精巣:7.24

心臓:8.17

骨格筋:8.11

食道:-

胃:7.90

腸:7.90

結腸:-

肝臓:8.10

肺:7.64

膀胱:7.86

腎臓:7.90

下垂体:7.51

甲状腺:-

副腎:7.78

膵臓:8.30

乳腺:8.06

唾液腺:8.09

CAGE

子宮:3.31

胎盤:3.20

前立腺:3.58

卵巣:3.37

精巣:3.13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.54

腸:2.93

結腸:3.34

肝臓:3.62

肺:3.23

膀胱:3.06

腎臓:-

下垂体:3.23

甲状腺:-

副腎:3.36

膵臓:3.41

乳腺:3.54

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:5.23

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:6.53

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001136070
Gene ID	16865
Unigene ID	Mm.276294
Probe set ID	1455797_x_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000026427

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_001201478, NM_006893
ラット [0]

染色体

1E4 [133,049,758 - 133,084,235]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002478	Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase
IPR015947	Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

9070942
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
15782199
16141072
16141073
18799693

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006412	translation
GO:0006413	translational initiation

Cellular Component

Molecular Function

GO:0003723	RNA binding
GO:0003743	translation initiation factor activity