serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble)

同義遺伝子名

mshmt2, mshmt, Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic, C81125, Serine methylase, AI324848, Shmt, Glycine hydroxymethyltransferase, SHMT, Shmt1, AI385541, serine hydroxymethyl transferase 1 (soluble), mshmt1

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:22.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:32.10

目:15.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.80

末梢血:-

脾臓:26.30

胸腺:88.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:37.60

皮膚:55.40

GeneChip

大脳:5.37

小脳:5.81

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:5.33

脊柱:5.56

網膜:5.22

目:5.57

動脈:-

静脈:5.95

リンパ節:6.57

末梢血:-

脾臓:6.40

胸腺:-

骨髄:6.59

脂肪:6.79

骨:5.89

皮膚:6.53

CAGE

大脳:1.02

小脳:-

脳幹:0.58

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:0.66

網膜:-

目:-

動脈:3.04

静脈:-

リンパ節:2.05

末梢血:-

脾臓:1.60

胸腺:1.99

骨髄:-

脂肪:-

骨:2.09

皮膚:2.45

RNA-seq

大脳:1.62

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:130.90

胎盤:124.30

前立腺:-

卵巣:23

精巣:73.90

心臓:55.80

骨格筋:-

食道:-

胃:98.20

腸:37

結腸:35.20

肝臓:181

肺:40.20

膀胱:66.20

腎臓:16.10

下垂体:90.40

甲状腺:112.50

副腎:-

膵臓:46.90

乳腺:78.40

唾液腺:54

GeneChip

子宮:6.85

胎盤:6.19

前立腺:7.72

卵巣:6.56

精巣:8.28

心臓:6.22

骨格筋:6.93

食道:-

胃:7.59

腸:8.12

結腸:-

肝臓:10.58

肺:6.18

膀胱:6.24

腎臓:8.73

下垂体:5.75

甲状腺:-

副腎:5.91

膵臓:6.28

乳腺:7.46

唾液腺:6.09

CAGE

子宮:2.39

胎盤:1.82

前立腺:2.57

卵巣:2.14

精巣:2.98

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.79

腸:3.28

結腸:2.84

肝臓:5.18

肺:1.22

膀胱:2.10

腎臓:-

下垂体:0.70

甲状腺:-

副腎:2.47

膵臓:1.30

乳腺:3.03

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.74

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:19.73

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_009171
Gene ID	20425
Unigene ID	Mm.364956
Probe set ID	1422198_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000020534

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_004169, NM_148918
ラット[1]	NM_001047842, NM_148918

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0046655	folic acid metabolic process
GO:0006545	glycine biosynthetic process
GO:0019264	glycine biosynthetic process from serine
GO:0006544	glycine metabolic process
GO:0006565	L-serine catabolic process
GO:0006563	L-serine metabolic process
GO:0006730	one-carbon metabolic process
GO:0051289	protein homotetramerization
GO:0051262	protein tetramerization
GO:0009113	purine base biosynthetic process

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0016597	amino acid binding
GO:0003824	catalytic activity
GO:0004372	glycine hydroxymethyltransferase activity
GO:0042802	identical protein binding
GO:0008732	L-allo-threonine aldolase activity
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding
GO:0016740	transferase activity

serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function