polynucleotide kinase 3'- phosphatase

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同義遺伝子名

Polynucleotide kinase-3'-phosphatase, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, 1810009G08Rik, PNK, Pnkp, DNA 5'-kinase/3'-phosphatase, polynucleotide kinase 3'- phosphatase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:43.40 小脳:184.20 脳幹:222.50 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:94.60 網膜:64.30 目:22.80 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:54 末梢血:28.80 脾臓:237 胸腺:168 骨髄:38.50 脂肪:- 骨:162.80 皮膚:55.40
GeneChip 大脳:6.71 小脳:6.76 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.10 脊柱:6.75 網膜:6.31 目:6.87 動脈:- 静脈:6.43 リンパ節:8.13 末梢血:- 脾臓:8.09 胸腺:- 骨髄:9.38 脂肪:7.42 骨:8.98 皮膚:6.92
CAGE 大脳:2.52 小脳:- 脳幹:2.32 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.25 網膜:- 目:- 動脈:2.16 静脈:- リンパ節:2.50 末梢血:- 脾臓:3.15 胸腺:2.84 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.79 皮膚:2.28
RNA-seq 大脳:4.34 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:36.90 心臓:37.20 骨格筋:71 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:52.90     肝臓:72.40        肺:90.40    膀胱:198.50 腎臓:48.40 下垂体:193.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:32.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.22 胎盤:7.36 前立腺:7.49 卵巣:7.29 精巣:7.88 心臓:6.98 骨格筋:7.75 食道:- 胃:7.14 腸:7.27 結腸:- 肝臓:8.21 肺:7.33 膀胱:6.93 腎臓:7.33 下垂体:6.87 甲状腺:- 副腎:7.12 膵臓:6.49 乳腺:7.25 唾液腺:6.88
CAGE 子宮:2.39 胎盤:2.59 前立腺:2.37 卵巣:2.44 精巣:3.25 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.52 腸:2.43 結腸:2.62     肝臓:2.74    肺:2.67 膀胱:2.38 腎臓:- 下垂体:2.73 甲状腺:- 副腎:2.70 膵臓:2.45 乳腺:2.45 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.88 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.68        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_021549
Gene ID 59047
Unigene ID Mm.238254
Probe set ID 1416378_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000002963

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_007254
ラット[1]  NM_001004259

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006551  DNA 3-phosphatase
IPR006549  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIIA
IPR013954  Polynucleotide kinase 3 phosphatase, central region
IPR015636  Polynucleotide kinase 3, phosphatase
IPR006550  Polynucleotide kinase 3-phosphatase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
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21677750
22055185
22171004
23042675
23042680

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016311  dephosphorylation
GO:0042769  DNA damage response, detection of DNA damage
GO:0006281  DNA repair
GO:0008152  metabolic process
GO:0046939  nucleotide phosphorylation
GO:0016310  phosphorylation
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006979  response to oxidative stress

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0046404  ATP-dependent polydeoxyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity
GO:0003824  catalytic activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016301  kinase activity
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0019201  nucleotide kinase activity
GO:0046403  polynucleotide 3'-phosphatase activity
GO:0016740  transferase activity