high mobility group 20A

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同義遺伝子名

HMG domain protein HMGX1, Ibraf, Hmg20a, High mobility group protein 20A, HMG box-containing protein 20A, 1200004E06Rik, Inhibitor of BRAF35, 5730490E10Rik, high mobility group 20A, iBRAF

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:152.80 小脳:73.70 脳幹:158.90 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:152.90 脊柱:- 網膜:160.70 目:167.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:43.20 末梢血:100.60 脾臓:52.70 胸腺:276.60 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:112.70 皮膚:71.30
GeneChip 大脳:9.99 小脳:9.82 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.46 脊柱:9.27 網膜:9.38 目:8.95 動脈:- 静脈:9.19 リンパ節:9.45 末梢血:- 脾臓:9.52 胸腺:- 骨髄:8.79 脂肪:9.04 骨:8.61 皮膚:8.92
CAGE 大脳:4.10 小脳:- 脳幹:3.88 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.76 網膜:- 目:- 動脈:3.74 静脈:- リンパ節:4.40 末梢血:- 脾臓:3.28 胸腺:4.30 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.25 皮膚:3.81
RNA-seq 大脳:5.27 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:261.70 胎盤:69 前立腺:92.60 卵巣:68.90 精巣:29.60 心臓:93 骨格筋:- 食道:- 胃:294.60 腸:- 結腸:70.50     肝臓:-        肺:50.20    膀胱:- 腎臓:72.50 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:159.50 乳腺:35.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.55 胎盤:8.69 前立腺:8.66 卵巣:9.67 精巣:7.38 心臓:8.53 骨格筋:8.77 食道:- 胃:8.38 腸:8.57 結腸:- 肝臓:8.01 肺:9.21 膀胱:9.06 腎臓:8.72 下垂体:9.56 甲状腺:- 副腎:9.65 膵臓:8.01 乳腺:8.99 唾液腺:8.08
CAGE 子宮:3.58 胎盤:3.29 前立腺:3.14 卵巣:3.64 精巣:3.18 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.66 腸:2.78 結腸:2.81     肝臓:2.88    肺:3.68 膀胱:3.39 腎臓:- 下垂体:3.80 甲状腺:- 副腎:3.52 膵臓:3.21 乳腺:3.07 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.15 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.50        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_025812
Gene ID 66867
Unigene ID Mm.150856
Probe set ID 1416722_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000032329

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_018200
ラット[1]  NM_001108150

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10773667
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
15102471
15489334
15618518
16141072
16141073
16227968
17609113
18287559
18799693
20059953
20412781
20530487
20932939
21267068
22496869
22558309
22570500
23707952

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0045665  negative regulation of neuron differentiation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity