exoribonuclease 1

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同義遺伝子名

3'-5' exonuclease ERI1, three prime histone mRNA exonuclease 1, Eri-1 homolog, 3110010F15Rik, 3' histone mRNA exonuclease 1, 3'exo, 3'hexo, Eri1, Thex1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:34.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:95.50 脊柱:- 網膜:- 目:129.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:43.10 脾臓:105.30 胸腺:256.90 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:150.30 皮膚:63.30
GeneChip 大脳:5.62 小脳:6.05 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.05 脊柱:5.69 網膜:6.28 目:6.06 動脈:- 静脈:6.73 リンパ節:7.71 末梢血:- 脾臓:7.30 胸腺:- 骨髄:8.80 脂肪:5.72 骨:8.52 皮膚:6.27
CAGE 大脳:2.56 小脳:- 脳幹:2.15 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.66 網膜:- 目:- 動脈:2.59 静脈:- リンパ節:3.80 末梢血:- 脾臓:3.98 胸腺:4.19 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.97 皮膚:3.56
RNA-seq 大脳:1.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:51.70 心臓:18.60 骨格筋:71 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:17.60     肝臓:54.30        肺:20.10    膀胱:132.40 腎臓:16.10 下垂体:77.50 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:65.70 乳腺:42.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.71 胎盤:6.30 前立腺:5.91 卵巣:6.82 精巣:4.53 心臓:5.50 骨格筋:5.11 食道:- 胃:6.27 腸:6.66 結腸:- 肝臓:6.37 肺:6.09 膀胱:5.80 腎臓:5.81 下垂体:6.03 甲状腺:- 副腎:6.28 膵臓:5.63 乳腺:6.52 唾液腺:6.04
CAGE 子宮:3.07 胎盤:3.20 前立腺:2.37 卵巣:2.98 精巣:3.06 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.79 腸:2.64 結腸:2.79     肝臓:2.66    肺:2.96 膀胱:2.69 腎臓:- 下垂体:2.83 甲状腺:- 副腎:2.91 膵臓:2.33 乳腺:3.29 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.20        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_026067
Gene ID 67276
Unigene ID Mm.207534
Probe set ID 1418828_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000031527

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_153332
ラット[1]  NM_001014143

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006055  Exonuclease
IPR013520  Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III
IPR012337  Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H fold

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
15489334
15618518
16004606
16141072
16141073
18438418
19470752
20059953
20412781
21565611
21677750
22039495
22613798
23202588

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0031047  gene silencing by RNA
GO:0031125  rRNA 3'-end processing
GO:0006364  rRNA processing

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0071204  histone pre-mRNA 3'end processing complex
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0008408  3'-5' exonuclease activity
GO:0004527  exonuclease activity
GO:0071207  histone pre-mRNA stem-loop binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004518  nuclease activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0043022  ribosome binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0019843  rRNA binding