leucine-rich repeats and WD repeat domain containing 1

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同義遺伝子名

1200011O22Rik, AW548074, AU042569, RIKEN cDNA 1200011O22 gene

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:38.20 小脳:239.50 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:152.90 脊柱:236.40 網膜:32.10 目:45.60 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:100.60 脾臓:184.30 胸腺:168 骨髄:38.50 脂肪:- 骨:175.30 皮膚:63.30
GeneChip 大脳:7.33 小脳:7.34 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.64 脊柱:6.58 網膜:7.83 目:8.18 動脈:- 静脈:8.27 リンパ節:9.18 末梢血:- 脾臓:8.90 胸腺:- 骨髄:10.15 脂肪:7.70 骨:10.27 皮膚:8.52
CAGE 大脳:2.51 小脳:- 脳幹:2.47 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.36 網膜:- 目:- 動脈:2.05 静脈:- リンパ節:2.69 末梢血:- 脾臓:3.73 胸腺:3.72 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.64 皮膚:2.21
RNA-seq 大脳:3.35 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:41.40 前立腺:- 卵巣:46 精巣:258.60 心臓:18.60 骨格筋:106.50 食道:- 胃:- 腸:37 結腸:17.60     肝臓:45.30        肺:170.70    膀胱:66.20 腎臓:32.20 下垂体:51.70 甲状腺:112.50 副腎:424.40 膵臓:18.80 乳腺:78.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.47 胎盤:8.15 前立腺:7.51 卵巣:8.60 精巣:11.70 心臓:6.93 骨格筋:7.08 食道:- 胃:7.30 腸:7.83 結腸:- 肝臓:7.55 肺:8.22 膀胱:7.91 腎臓:6.99 下垂体:7.51 甲状腺:- 副腎:8.63 膵臓:7.87 乳腺:7.98 唾液腺:8.02
CAGE 子宮:2.73 胎盤:2.82 前立腺:1.91 卵巣:2.60 精巣:6.28 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.35 腸:1.92 結腸:2.53     肝臓:2.32    肺:2.48 膀胱:2.35 腎臓:- 下垂体:2.73 甲状腺:- 副腎:2.57 膵臓:2.45 乳腺:2.25 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.66 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:6.93        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_027891
Gene ID 71735
Unigene ID Mm.425292
Probe set ID 1437194_x_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000029703

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_152892
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15782199
16141072
16141073
18799693
20180869
20932478
21267068
21677750
22427655

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0006325  chromatin organization
GO:0006260  DNA replication
GO:0071169  establishment of protein localization to chromatin
GO:0000080  G1 phase of mitotic cell cycle

Cellular Component

GO:0005721  centromeric heterochromatin
GO:0005694  chromosome
GO:0000775  chromosome, centromeric region
GO:0000781  chromosome, telomeric region
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005664  nuclear origin of replication recognition complex
GO:0005634  nucleus
GO:0031933  telomeric heterochromatin

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0008327  methyl-CpG binding
GO:0035064  methylated histone residue binding