HMG box domain containing 4

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同義遺伝子名

high-mobility group protein 2-like 1, High mobility group protein 2-like 1, HMG2L1, Protein HMGBCG, THC211630, HMGBCG

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:21.30 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:5.71 小脳:5.69 脳幹:5.64 脳梁:6.26 松果体:- 末梢神経:5.76 脊柱:5.79 網膜:- 目:- 動脈:5.66 静脈:5.61 リンパ節:5.77 末梢血:- 脾臓:5.68 胸腺:6.23 骨髄:5.90 脂肪:5.85 骨:- 皮膚:5.96
CAGE 大脳:3.23 小脳:- 脳幹:3.30 脳梁:3.51 松果体:3.39 末梢神経:- 脊柱:3.46 網膜:- 目:- 動脈:2.97 静脈:3.23 リンパ節:2.75 末梢血:- 脾臓:2.99 胸腺:3.46 骨髄:- 脂肪:3.08 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.79 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.05 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:72.90 前立腺:78.90 卵巣:74.50 精巣:21.60 心臓:12.80 骨格筋:60.30 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:33.90     肝臓:147.80        肺:63.50    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.43 胎盤:6.55 前立腺:6.48 卵巣:6.44 精巣:6.64 心臓:5.50 骨格筋:5.44 食道:5.92 胃:5.86 腸:5.87 結腸:5.60 肝臓:5.53 肺:5.45 膀胱:- 腎臓:5.31 下垂体:5.35 甲状腺:5.82 副腎:5.91 膵臓:4.79 乳腺:6.47 唾液腺:5.45
CAGE 子宮:3.38 胎盤:3.56 前立腺:3.10 卵巣:3.31 精巣:3.24 心臓:2.87 骨格筋:3.24 食道:3.12 胃:- 腸:3.22 結腸:2.86     肝臓:2.65    肺:2.97 膀胱:3.41 腎臓:2.86 下垂体:2.74 甲状腺:2.70 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:2.47 唾液腺:2.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.40 卵巣:2.84 精巣:2.57 心臓:1.29 骨格筋:1.47 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.36     肝臓:0.78        肺:1.30    膀胱:- 腎臓:1.49 下垂体:- 甲状腺:2.20 副腎:2.65 膵臓:- 乳腺:1.66 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001003681
Gene ID 10042
Unigene ID Hs.588815
Probe set ID 212597_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000100281
GTEx ID ENSG00000100281

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_178017
ラット[1]  NM_001107412

染色体

22q12.3  [35,653,445  -  35,691,800]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10329004
10591208
12477932
12529303
15461802
16455055
17671966
18029348
20379614
20511232
20800603
21900206
22939629
23455924

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008333  endosome to lysosome transport
GO:0030178  negative regulation of Wnt receptor signaling pathway
GO:0016055  Wnt receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0016589  NURF complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding