RAD50 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

hRad50, RAD50, DNA repair protein RAD50, RAD50 homolog (S. cerevisiae), hRAD50, RAD50 (S. cerevisiae) homolog, RAD50-2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.85

小脳:4.25

脳幹:5.01

脳梁:5.09

松果体:-

末梢神経:5.25

脊柱:5

網膜:-

目:-

動脈:5.39

静脈:5

リンパ節:5.23

末梢血:-

脾臓:5

胸腺:5.63

骨髄:5.04

脂肪:5.29

骨:-

皮膚:5.49

CAGE

大脳:3.12

小脳:-

脳幹:3.29

脳梁:2.63

松果体:3.20

末梢神経:-

脊柱:3.11

網膜:-

目:-

動脈:2.34

静脈:2.77

リンパ節:2.75

末梢血:-

脾臓:3.29

胸腺:3.21

骨髄:-

脂肪:3.02

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.89

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.75

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.55

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.86

胎盤:5.75

前立腺:6.08

卵巣:5.80

精巣:6.46

心臓:5.27

骨格筋:4.70

食道:5.48

胃:5.15

腸:4.92

結腸:4.69

肝臓:5.33

肺:5.05

膀胱:-

腎臓:5.10

下垂体:5.48

甲状腺:5.37

副腎:5.64

膵臓:4.80

乳腺:5.22

唾液腺:4.91

CAGE

子宮:2.87

胎盤:3.29

前立腺:3.31

卵巣:3.31

精巣:3.17

心臓:3.02

骨格筋:3.32

食道:3.35

胃:-

腸:3.41

結腸:2.90

肝臓:3.33

肺:3.04

膀胱:3.28

腎臓:3.31

下垂体:3.58

甲状腺:3.11

副腎:-

膵臓:2.54

乳腺:3.30

唾液腺:2.22

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.49

卵巣:3.68

精巣:3.74

心臓:2.97

骨格筋:3.03

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.18

肝臓:2.47

肺:1.76

膀胱:-

腎臓:3.26

下垂体:-

甲状腺:3.51

副腎:2.79

膵臓:-

乳腺:2.95

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005732
Gene ID	10111
Unigene ID	-
Probe set ID	208393_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000113522
GTEx ID	ENSG00000113522

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_009012
ラット[1]	NM_022246

染色体

5q31.1 [131,891,711 - 131,980,313]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR013134

Zinc hook, Rad50

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0032508	DNA duplex unwinding
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0000724	double-strand break repair via homologous recombination
GO:0033674	positive regulation of kinase activity
GO:0031954	positive regulation of protein amino acid autophosphorylation
GO:0007131	reciprocal meiotic recombination
GO:0000019	regulation of mitotic recombination
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0000723	telomere maintenance
GO:0007004	telomere maintenance via telomerase

Cellular Component

GO:0030870	Mre11 complex
GO:0000784	nuclear chromosome, telomeric region
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0045120	pronucleus

Molecular Function

GO:0008408	3'-5' exonuclease activity
GO:0005524	ATP binding
GO:0004003	ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0030674	protein binding, bridging
GO:0000014	single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease activity
GO:0008270	zinc ion binding

RAD50 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function