FERM, RhoGEF (ARHGEF) and pleckstrin domain protein 1 (chondrocyte-derived)

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同義遺伝子名

MGC87400, Chondrocyte-derived ezrin-like protein, FARP1, CDEP, PLEKHC2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:130.40 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:355.90 目:176.30 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:75.60 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:76.80 皮膚:201.60
GeneChip 大脳:5.77 小脳:4.82 脳幹:5.61 脳梁:5.57 松果体:- 末梢神経:4.67 脊柱:5.92 網膜:- 目:- 動脈:5.54 静脈:5.87 リンパ節:5.26 末梢血:- 脾臓:5.27 胸腺:4.28 骨髄:4.47 脂肪:5.60 骨:- 皮膚:5.60
CAGE 大脳:3.78 小脳:- 脳幹:3.11 脳梁:3.55 松果体:3.82 末梢神経:- 脊柱:3.87 網膜:- 目:- 動脈:3.35 静脈:2.96 リンパ節:2.92 末梢血:- 脾臓:3.36 胸腺:1.81 骨髄:- 脂肪:3.37 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.99 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.03 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.79 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:209.60 胎盤:69.20 前立腺:78.90 卵巣:298.10 精巣:99.50 心臓:114.90 骨格筋:- 食道:- 胃:85 腸:- 結腸:407     肝臓:84.40        肺:117.30    膀胱:- 腎臓:218.30 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:35.60 乳腺:353.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.35 胎盤:5.64 前立腺:6.74 卵巣:6.28 精巣:6.80 心臓:5.36 骨格筋:5.79 食道:4.88 胃:6.29 腸:6.55 結腸:6.48 肝臓:6.62 肺:6.66 膀胱:- 腎臓:7.77 下垂体:5.73 甲状腺:6.93 副腎:6.48 膵臓:6.40 乳腺:6.62 唾液腺:7.02
CAGE 子宮:3.75 胎盤:3.42 前立腺:3.84 卵巣:3.51 精巣:3.00 心臓:3.22 骨格筋:2.78 食道:2.96 胃:- 腸:2.77 結腸:3.87     肝臓:4.45    肺:4.34 膀胱:3.58 腎臓:4.55 下垂体:3.94 甲状腺:4.34 副腎:- 膵臓:4.38 乳腺:4.44 唾液腺:4.28
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.87 卵巣:3.93 精巣:3.94 心臓:2.16 骨格筋:1.77 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.26     肝臓:4.06        肺:3.96    膀胱:- 腎臓:4.83 下垂体:- 甲状腺:3.80 副腎:3.30 膵臓:- 乳腺:3.20 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005766
Gene ID 10160
Unigene ID Hs.403917
Probe set ID 201911_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000152767
GTEx ID ENSG00000152767

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_134082
ラット[1]  NM_001107287

染色体

13q32.2  [98,795,434  -  99,102,023]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019749  Band 4.1 domain
IPR019750  Band 4.1 subgroup
IPR000798  Ezrin/radixin/moesin ERM
IPR001849  Pleckstrin homology

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9425278
11076863
12477932
14702039
15057823
15489334
15489336
16341674
16381901
19217374
19322201
19389623
19475631
20171287
20379614
20708005
21116278
21139048
21906983
22952603
23209303
23251661
23375260
23793025

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048813  dendrite morphogenesis
GO:0010923  negative regulation of phosphatase activity
GO:0035023  regulation of Rho protein signal transduction
GO:0007416  synapse assembly

Cellular Component

GO:0030054  cell junction
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005829  cytosol
GO:0030425  dendrite
GO:0043197  dendritic spine
GO:0031234  extrinsic to internal side of plasma membrane
GO:0030175  filopodium
GO:0045202  synapse

Molecular Function

GO:0008092  cytoskeletal protein binding
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0030676  Rac guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity