CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase-like

同義遺伝子名

Nuclear LIM interactor-interacting factor 1, Small C-terminal domain phosphatase 3, RBSP3, NIF1, SCP3, CTDSP-like, YA22 protein, CTDSPL, C3orf8, NIFL, NIF-like protein, CTD small phosphatase-like protein, chromosome 3 open reading frame 8, NLI-interacting factor 1, YA22, PSR1, Small CTD phosphatase 3, HYA22

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:32

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:92

脊柱:112.30

網膜:237.30

目:35.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:121

骨:51.20

皮膚:86.40

GeneChip

大脳:4.74

小脳:4.76

脳幹:4.83

脳梁:4.61

松果体:-

末梢神経:5.09

脊柱:4.78

網膜:-

目:-

動脈:5.16

静脈:5.03

リンパ節:4.53

末梢血:-

脾臓:4.62

胸腺:4.37

骨髄:5.05

脂肪:5.12

骨:-

皮膚:5.36

CAGE

大脳:2.61

小脳:-

脳幹:2.27

脳梁:2.46

松果体:2.51

末梢神経:-

脊柱:2.48

網膜:-

目:-

動脈:3.38

静脈:2.63

リンパ節:2.15

末梢血:-

脾臓:2.57

胸腺:1.40

骨髄:-

脂肪:2.47

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.82

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.82

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:196.70

前立腺:169

卵巣:111.80

精巣:69.20

心臓:217.10

骨格筋:60.30

食道:-

胃:42.50

腸:32.40

結腸:203.50

肝臓:-

肺:151.50

膀胱:-

腎臓:93.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:62.20

乳腺:176.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.99

胎盤:5.08

前立腺:5.08

卵巣:4.83

精巣:4.98

心臓:4.88

骨格筋:4.87

食道:5.16

胃:5.13

腸:5.25

結腸:5.50

肝臓:5.02

肺:4.87

膀胱:-

腎臓:5.30

下垂体:4.79

甲状腺:4.85

副腎:4.76

膵臓:5.25

乳腺:5.07

唾液腺:5.93

CAGE

子宮:3.02

胎盤:2.87

前立腺:3.24

卵巣:2.67

精巣:2.58

心臓:2.97

骨格筋:2.13

食道:3.11

胃:-

腸:2.63

結腸:3.45

肝臓:2.41

肺:3.34

膀胱:3.23

腎臓:3.34

下垂体:2.11

甲状腺:2.48

副腎:-

膵臓:2.48

乳腺:3.35

唾液腺:3.84

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.72

卵巣:3.27

精巣:2.95

心臓:3.30

骨格筋:0.77

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.25

肝臓:2.10

肺:3.36

膀胱:-

腎臓:3.83

下垂体:-

甲状腺:0.25

副腎:2.11

膵臓:-

乳腺:3.02

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005808
Gene ID	10217
Unigene ID	Hs.475963
Probe set ID	201905_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000144677
GTEx ID	ENSG00000144677

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_133710
ラット[1]	NM_001106865

染色体

3p22.2 [37,903,451 - 38,025,960]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011948	Dullard-like phosphatase domain
IPR004274	NLI interacting factor

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008150

biological_process

Cellular Component

GO:0005575	cellular_component
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0046872	metal ion binding
GO:0003674	molecular_function
GO:0004721	phosphoprotein phosphatase activity

CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase-like

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function