serine/arginine repetitive matrix 1

同義遺伝子名

SR-related nuclear matrix protein of 160 kDa, SRm160, POP101, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, SRM160, Ser/Arg-related nuclear matrix protein, MGC39488, 160-KD, SRRM1, serine/arginine repetitive matrix 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:86.50

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:175

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:449.20

網膜:355.90

目:141

動脈:89.90

静脈:266.60

リンパ節:131.40

末梢血:127.50

脾臓:132.30

胸腺:77.30

骨髄:19.70

脂肪:161.30

骨:64

皮膚:105.60

GeneChip

大脳:7.99

小脳:8.41

脳幹:8.03

脳梁:8.85

松果体:-

末梢神経:8.18

脊柱:8.43

網膜:-

目:-

動脈:8.18

静脈:8.13

リンパ節:8.63

末梢血:-

脾臓:8.66

胸腺:8.86

骨髄:8.31

脂肪:8.39

骨:-

皮膚:8.19

CAGE

大脳:4.13

小脳:-

脳幹:4.39

脳梁:4.65

松果体:4.24

末梢神経:-

脊柱:4.56

網膜:-

目:-

動脈:3.79

静脈:3.75

リンパ節:4.10

末梢血:-

脾臓:4.30

胸腺:4.54

骨髄:-

脂肪:4.21

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.06

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.21

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.19

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:83.80

前立腺:135.20

卵巣:37.30

精巣:103.80

心臓:38.30

骨格筋:20.10

食道:342.80

胃:85

腸:162

結腸:50.90

肝臓:358.90

肺:102.60

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:-

甲状腺:327.50

副腎:50.80

膵臓:88.90

乳腺:241.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.73

胎盤:8.59

前立腺:9.09

卵巣:8.82

精巣:8.48

心臓:8.05

骨格筋:7.74

食道:8.13

胃:8.33

腸:8.22

結腸:8.27

肝臓:7.83

肺:8.36

膀胱:-

腎臓:8.12

下垂体:8.21

甲状腺:8.66

副腎:8.17

膵臓:7.64

乳腺:8.74

唾液腺:8.50

CAGE

子宮:4.54

胎盤:4.27

前立腺:4.19

卵巣:4.24

精巣:4.07

心臓:3.57

骨格筋:4.23

食道:3.99

胃:-

腸:4.24

結腸:3.77

肝臓:4.06

肺:3.96

膀胱:4.28

腎臓:4.09

下垂体:4.45

甲状腺:3.75

副腎:-

膵臓:3.47

乳腺:3.19

唾液腺:4.18

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.24

卵巣:4.82

精巣:4.78

心臓:3.17

骨格筋:3.55

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.54

肝臓:3.30

肺:4.46

膀胱:-

腎臓:3.98

下垂体:-

甲状腺:4.72

副腎:4.51

膵臓:-

乳腺:4.42

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005839
Gene ID	10250
Unigene ID	Hs.18192
Probe set ID	201225_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000133226
GTEx ID	ENSG00000133226

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_001130477, NM_016799
ラット [0]

染色体

1p36.11 [24,958,207 - 24,999,758]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0010467	gene expression
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005829	cytosol
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

GO:0003677	DNA binding
GO:0003723	RNA binding

serine/arginine repetitive matrix 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function