katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1, p80 katanin, Katanin p80 subunit B1, katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1, Katanin p80 WD40-containing subunit B1, KATNB1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:64 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:105.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:164 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.28 小脳:6.82 脳幹:6.91 脳梁:6.46 松果体:- 末梢神経:6.63 脊柱:6.59 網膜:- 目:- 動脈:6.27 静脈:6.61 リンパ節:6.63 末梢血:- 脾臓:6.35 胸腺:6.55 骨髄:6.77 脂肪:6.57 骨:- 皮膚:6.96
CAGE 大脳:2.75 小脳:- 脳幹:2.49 脳梁:2.40 松果体:1.98 末梢神経:- 脊柱:2.10 網膜:- 目:- 動脈:1.68 静脈:2.03 リンパ節:2.27 末梢血:- 脾臓:2.19 胸腺:2.37 骨髄:- 脂肪:2.22 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.86 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.22 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:18.20 前立腺:33.80 卵巣:186.30 精巣:34.60 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.21 胎盤:5.99 前立腺:6.12 卵巣:6.52 精巣:8.12 心臓:6.47 骨格筋:6.29 食道:6.83 胃:6.37 腸:6.48 結腸:6.66 肝臓:5.96 肺:6.47 膀胱:- 腎臓:6.49 下垂体:6.70 甲状腺:6.53 副腎:6.67 膵臓:6.73 乳腺:6.87 唾液腺:6.83
CAGE 子宮:2.03 胎盤:2.16 前立腺:1.96 卵巣:1.87 精巣:3.65 心臓:1.66 骨格筋:1.76 食道:2.45 胃:- 腸:2.15 結腸:2.36     肝臓:2.38    肺:2.11 膀胱:1.49 腎臓:2.01 下垂体:2.04 甲状腺:2.15 副腎:- 膵臓:2.18 乳腺:1.36 唾液腺:2.72
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.85 卵巣:2.13 精巣:3.82 心臓:1.08 骨格筋:1.53 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.64     肝臓:1.30        肺:1.98    膀胱:- 腎臓:1.80 下垂体:- 甲状腺:2.32 副腎:2.32 膵臓:- 乳腺:2.21 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005886
Gene ID 10300
Unigene ID Hs.275675
Probe set ID 203162_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000140854
GTEx ID ENSG00000140854

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_028805
ラット[1]  NM_001024746

染色体

16q21  [57,769,642  -  57,791,162]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

6646120
8221885
8907702
9568719
9658175
10209026
10751153
12477932
15215300
15231747
15489334
15761153
16203747
17081983
18029348
18490357
19261606
19531213
19946888
20508983
21890473
22325007
22939629
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051301  cell division
GO:0051013  microtubule severing
GO:0007067  mitosis
GO:0007026  negative regulation of microtubule depolymerization
GO:0010942  positive regulation of cell death
GO:0031117  positive regulation of microtubule depolymerization
GO:0010976  positive regulation of neuron projection development
GO:0006605  protein targeting

Cellular Component

GO:0030424  axon
GO:0043025  cell soma
GO:0005813  centrosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0030426  growth cone
GO:0008352  katanin complex
GO:0005874  microtubule
GO:0015630  microtubule cytoskeleton
GO:0030496  midbody
GO:0005886  plasma membrane
GO:0000922  spindle pole

Molecular Function

GO:0045502  dynein binding
GO:0008017  microtubule binding
GO:0008568  microtubule-severing ATPase activity
GO:0046982  protein heterodimerization activity