katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1

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同義遺伝子名

katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1, p80 katanin, Katanin p80 subunit B1, katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1, Katanin p80 WD40-containing subunit B1, KATNB1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:64 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:105.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:164 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.95 小脳:4.57 脳幹:4.53 脳梁:4.28 松果体:- 末梢神経:4.48 脊柱:4.19 網膜:- 目:- 動脈:4.11 静脈:4.16 リンパ節:4.39 末梢血:- 脾臓:4.27 胸腺:5.03 骨髄:4.48 脂肪:4.37 骨:- 皮膚:4.88
CAGE 大脳:2.75 小脳:- 脳幹:2.49 脳梁:2.40 松果体:1.98 末梢神経:- 脊柱:2.10 網膜:- 目:- 動脈:1.68 静脈:2.03 リンパ節:2.27 末梢血:- 脾臓:2.19 胸腺:2.37 骨髄:- 脂肪:2.22 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.86 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.22 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:18.20 前立腺:33.80 卵巣:186.30 精巣:34.60 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.29 胎盤:4.08 前立腺:4.29 卵巣:4.59 精巣:6.58 心臓:4.09 骨格筋:4.19 食道:4.67 胃:4.16 腸:4.61 結腸:4.26 肝臓:3.93 肺:4.42 膀胱:- 腎臓:4.11 下垂体:4.43 甲状腺:4.29 副腎:4.29 膵臓:5.38 乳腺:4.63 唾液腺:4.50
CAGE 子宮:2.03 胎盤:2.16 前立腺:1.96 卵巣:1.87 精巣:3.65 心臓:1.66 骨格筋:1.76 食道:2.45 胃:- 腸:2.15 結腸:2.36     肝臓:2.38    肺:2.11 膀胱:1.49 腎臓:2.01 下垂体:2.04 甲状腺:2.15 副腎:- 膵臓:2.18 乳腺:1.36 唾液腺:2.72
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.85 卵巣:2.13 精巣:3.82 心臓:1.08 骨格筋:1.53 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.64     肝臓:1.30        肺:1.98    膀胱:- 腎臓:1.80 下垂体:- 甲状腺:2.32 副腎:2.32 膵臓:- 乳腺:2.21 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005886
Gene ID 10300
Unigene ID Hs.275675
Probe set ID 203163_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000140854
GTEx ID ENSG00000140854

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_028805
ラット[1]  NM_001024746

染色体

16q21  [57,769,642  -  57,791,162]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

6646120
8221885
8907702
9568719
9658175
10209026
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15215300
15231747
15489334
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18029348
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19261606
19531213
19946888
20508983
21890473
22325007
22939629
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051301  cell division
GO:0051013  microtubule severing
GO:0007067  mitosis
GO:0007026  negative regulation of microtubule depolymerization
GO:0010942  positive regulation of cell death
GO:0031117  positive regulation of microtubule depolymerization
GO:0010976  positive regulation of neuron projection development
GO:0006605  protein targeting

Cellular Component

GO:0030424  axon
GO:0043025  cell soma
GO:0005813  centrosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0030426  growth cone
GO:0008352  katanin complex
GO:0005874  microtubule
GO:0015630  microtubule cytoskeleton
GO:0030496  midbody
GO:0005886  plasma membrane
GO:0000922  spindle pole

Molecular Function

GO:0045502  dynein binding
GO:0008017  microtubule binding
GO:0008568  microtubule-severing ATPase activity
GO:0046982  protein heterodimerization activity