high-mobility group 20B

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同義遺伝子名

high-mobility group 20B, SMARCE1r, HMG20B, Structural DNA-binding protein BRAF35, pp8857, PP7706, SOXL, HMG domain protein HMG20B, FLJ26127, BRAF35, SMARCE1-related protein, SMARCE1R, Sox-like transcriptional factor, BRCA2-associated factor 35, BRAF25, HMGX2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:9.50 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:293.80 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:30.30 末梢血:54.70 脾臓:56.70 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:5.61 小脳:5.36 脳幹:5.66 脳梁:6.10 松果体:- 末梢神経:6.13 脊柱:5.86 網膜:- 目:- 動脈:6.28 静脈:6.64 リンパ節:5.99 末梢血:- 脾臓:5.99 胸腺:7.30 骨髄:5.94 脂肪:6.40 骨:- 皮膚:6.41
CAGE 大脳:2.51 小脳:- 脳幹:3.06 脳梁:3.18 松果体:2.26 末梢神経:- 脊柱:2.91 網膜:- 目:- 動脈:3.42 静脈:3.30 リンパ節:3.13 末梢血:- 脾臓:3.01 胸腺:3.87 骨髄:- 脂肪:3.15 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.45 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.33 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.39 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:14.60 前立腺:56.30 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:25.50 骨格筋:20.10 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:52.80        肺:132    膀胱:- 腎臓:104 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.59 胎盤:7.30 前立腺:7.47 卵巣:6.17 精巣:6.64 心臓:5.87 骨格筋:5.65 食道:6.28 胃:6.37 腸:6.35 結腸:6.57 肝臓:6.04 肺:6.26 膀胱:- 腎臓:6.45 下垂体:5.60 甲状腺:6.12 副腎:6.04 膵臓:6.22 乳腺:6.61 唾液腺:6.71
CAGE 子宮:3.53 胎盤:3.74 前立腺:3.63 卵巣:3.18 精巣:3.34 心臓:2.95 骨格筋:2.43 食道:3.48 胃:- 腸:3.20 結腸:3.63     肝臓:3.08    肺:3.18 膀胱:3.14 腎臓:3.34 下垂体:2.69 甲状腺:3.54 副腎:- 膵臓:3.23 乳腺:2.95 唾液腺:3.90
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.68 卵巣:4.32 精巣:4.50 心臓:2.78 骨格筋:2.67 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.55     肝臓:3.31        肺:4.20    膀胱:- 腎臓:4.31 下垂体:- 甲状腺:3.85 副腎:4.45 膵臓:- 乳腺:4.30 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006339
Gene ID 10362
Unigene ID Hs.406534
Probe set ID 209113_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000064961
GTEx ID ENSG00000064961

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001163165, NM_001163166, NM_010440
ラット[1]  NM_001108731, NM_001163166, NM_010440

染色体

19p13.3  [3,572,775  -  3,579,086]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR000135  High mobility group, HMG1/HMG2, subgroup
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10486208
10773667
11207365
11997092
12032298
12083779
12083780
12234937
12477932
12493763
12809554
14702039
15057824
15325272
15489334
16079794
16140033
16169070
16189514
17961134
18816836
19471022
20530487
21258344
21399666
21693764
21832049
22570500
22939629
23752268
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007596  blood coagulation
GO:0007049  cell cycle
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006325  chromatin organization
GO:0033234  negative regulation of protein sumoylation
GO:0045666  positive regulation of neuron differentiation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694  chromosome
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0003700  transcription factor activity