high-mobility group 20A

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

HMG domain-containing protein HMGX1, FLJ10739, HMGX1, high-mobility group 20A, High mobility group protein 20A, HMG20A, HMG box-containing protein 20A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:184.90 小脳:289.70 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:445 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:237.30 目:58.80 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:- 脾臓:151.30 胸腺:219 骨髄:- 脂肪:- 骨:89.60 皮膚:76.80
GeneChip 大脳:5.87 小脳:5.76 脳幹:5.70 脳梁:5.75 松果体:- 末梢神経:6.07 脊柱:5.84 網膜:- 目:- 動脈:5.82 静脈:5.30 リンパ節:6.33 末梢血:- 脾臓:7.58 胸腺:7.18 骨髄:5.36 脂肪:5.83 骨:- 皮膚:5.72
CAGE 大脳:3.41 小脳:- 脳幹:3.26 脳梁:3.47 松果体:3.47 末梢神経:- 脊柱:3.20 網膜:- 目:- 動脈:2.86 静脈:2.85 リンパ節:3.02 末梢血:- 脾臓:3.34 胸腺:3.63 骨髄:- 脂肪:2.77 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.71 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.27 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.82 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:309.80 胎盤:80.10 前立腺:11.30 卵巣:74.50 精巣:203.30 心臓:12.80 骨格筋:80.40 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:25.40     肝臓:21.10        肺:161.30    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:133.40 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.57 胎盤:5.48 前立腺:6.04 卵巣:6.34 精巣:6.75 心臓:5.98 骨格筋:6.33 食道:5.58 胃:5.95 腸:5.94 結腸:5.80 肝臓:6.08 肺:5.93 膀胱:- 腎臓:5.97 下垂体:5.99 甲状腺:6.27 副腎:6.15 膵臓:4.22 乳腺:6.24 唾液腺:5.85
CAGE 子宮:3.42 胎盤:2.78 前立腺:2.98 卵巣:3.32 精巣:3.33 心臓:2.91 骨格筋:3.47 食道:2.78 胃:- 腸:2.70 結腸:2.96     肝臓:2.88    肺:3.03 膀胱:2.99 腎臓:2.90 下垂体:3.49 甲状腺:3.08 副腎:- 膵臓:2.60 乳腺:2.27 唾液腺:2.85
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.45 卵巣:4.07 精巣:4.03 心臓:3.10 骨格筋:2.60 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.59     肝臓:2.41        肺:3.11    膀胱:- 腎臓:3.10 下垂体:- 甲状腺:3.43 副腎:3.33 膵臓:- 乳腺:3.02 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018200
Gene ID 10363
Unigene ID Hs.69594
Probe set ID 218152_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000140382
GTEx ID ENSG00000140382

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_025812
ラット[1]  NM_001108150

染色体

15q24.3  [77,712,993  -  77,777,949]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
10773667
12477932
14702039
15231748
15489334
16140033
16189514
16751776
18029348
19322201
20211142
20530487
20531441
21258344
21490949
21874001
22570500
22693455
23000965
23275563
23707952
23752268
24163370
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0006325  chromatin organization
GO:0045665  negative regulation of neuron differentiation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0003700  transcription factor activity