synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein

同義遺伝子名

SYNCRIP, dJ3J17.2, Glycine-and tyrosine-rich RNA-binding protein, NS1-associated protein 1, pp68, RP1-3J17.2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, HNRPQ1, hnRNP-Q, hnRNP Q, HNRPQ, GRY-RBP, NSAP1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:55.70

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:61.30

脊柱:224.60

網膜:237.30

目:99.90

動脈:30

静脈:-

リンパ節:212.30

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:77.30

骨髄:39.40

脂肪:80.70

骨:89.60

皮膚:110.40

GeneChip

大脳:5.40

小脳:5.47

脳幹:5.51

脳梁:6.26

松果体:-

末梢神経:6.29

脊柱:6.12

網膜:-

目:-

動脈:6.54

静脈:6.58

リンパ節:7.07

末梢血:-

脾臓:7.19

胸腺:7.92

骨髄:6.75

脂肪:6.81

骨:-

皮膚:6.89

CAGE

大脳:3.79

小脳:-

脳幹:3.93

脳梁:3.73

松果体:3.96

末梢神経:-

脊柱:4.02

網膜:-

目:-

動脈:4.07

静脈:3.98

リンパ節:4.04

末梢血:-

脾臓:3.89

胸腺:4.22

骨髄:-

脂肪:3.85

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.98

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.47

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:200.50

胎盤:112.90

前立腺:123.90

卵巣:37.30

精巣:47.60

心臓:63.90

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:50.90

肝臓:84.40

肺:102.60

膀胱:125.60

腎臓:104

下垂体:116

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:80

乳腺:241.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.14

胎盤:7.12

前立腺:7.20

卵巣:7.10

精巣:5.94

心臓:6.66

骨格筋:6.01

食道:7.10

胃:7.07

腸:7.01

結腸:6.74

肝臓:6.49

肺:6.88

膀胱:-

腎臓:6.58

下垂体:6.19

甲状腺:7.78

副腎:7.04

膵臓:6.67

乳腺:7.05

唾液腺:6.46

CAGE

子宮:4.19

胎盤:4.12

前立腺:3.86

卵巣:3.70

精巣:3.76

心臓:4.07

骨格筋:4.18

食道:4.01

胃:-

腸:3.69

結腸:3.74

肝臓:3.94

肺:3.72

膀胱:4.08

腎臓:3.87

下垂体:3.78

甲状腺:3.99

副腎:-

膵臓:4.06

乳腺:3.22

唾液腺:4.03

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.85

卵巣:1.43

精巣:0.04

心臓:1.96

骨格筋:1.27

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.26

肝臓:1.28

肺:1.77

膀胱:-

腎臓:0.01

下垂体:-

甲状腺:2.23

副腎:1.77

膵臓:-

乳腺:1.76

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001159673
Gene ID	10492
Unigene ID	Hs.571177
Probe set ID	217832_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000135316
GTEx ID	ENSG00000135316

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_019666, NM_019796
ラット[1]	NM_001047916, NM_019796

染色体

6q14.3 [86,267,696 - 86,353,510]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0071346	cellular response to interferon-gamma
GO:0070934	CRD-mediated mRNA stabilization
GO:0017148	negative regulation of translation
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006396	RNA processing
GO:0008380	RNA splicing
GO:0019048	virus-host interaction

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0070937	CRD-mediated mRNA stability complex
GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0071204	histone pre-mRNA 3'end processing complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0030529	ribonucleoprotein complex

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0008143	poly(A) RNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function