sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4F

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同義遺伝子名

SEMA4F, PRO2353, M-SEMA, Sema M, SEMAM, m-Sema M, Semaphorin-4F precursor, Semaphorin W, Semaphorin M, SEMAW, Sema W, m-Sema-M

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:100.70 小脳:75.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:36.40 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:6.55 小脳:6.94 脳幹:6.27 脳梁:6.20 松果体:- 末梢神経:7.05 脊柱:6.47 網膜:- 目:- 動脈:6.20 静脈:5.85 リンパ節:6.29 末梢血:- 脾臓:6.28 胸腺:6.27 骨髄:5.88 脂肪:6.35 骨:- 皮膚:5.84
CAGE 大脳:3.27 小脳:- 脳幹:2.14 脳梁:2.15 松果体:2.97 末梢神経:- 脊柱:2.42 網膜:- 目:- 動脈:2.56 静脈:2.20 リンパ節:2.14 末梢血:- 脾臓:1.76 胸腺:1.85 骨髄:- 脂肪:1.71 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.66 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.50 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.96 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:7.30 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:30.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.14 胎盤:6.30 前立腺:6.23 卵巣:6.18 精巣:6.41 心臓:5.77 骨格筋:5.92 食道:5.91 胃:6.10 腸:5.98 結腸:6.11 肝臓:5.59 肺:5.92 膀胱:- 腎臓:5.99 下垂体:6.83 甲状腺:6.40 副腎:5.89 膵臓:6.43 乳腺:6.24 唾液腺:5.77
CAGE 子宮:2.22 胎盤:0.95 前立腺:2.12 卵巣:2.05 精巣:1.81 心臓:1.77 骨格筋:1.53 食道:1.48 胃:- 腸:1.27 結腸:1.89     肝臓:0.63    肺:2.20 膀胱:1.80 腎臓:1.44 下垂体:2.35 甲状腺:1.82 副腎:- 膵臓:1.59 乳腺:2.41 唾液腺:2.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.60 卵巣:1.70 精巣:1.83 心臓:0.46 骨格筋:0.31 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.99     肝臓:0.23        肺:0.59    膀胱:- 腎臓:1.18 下垂体:- 甲状腺:1.20 副腎:1.00 膵臓:- 乳腺:1.47 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004263
Gene ID 10505
Unigene ID Hs.25887
Probe set ID 210124_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000135622
GTEx ID ENSG00000135622

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001113481, NM_011350
ラット[1]  NM_019272, NM_011350

染色体

2p13.1  [74,881,355  -  74,909,186]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9856463
10051670
11076863
11230166
11256614
11483650
11901358
12477932
14702039
15489334
15489336
15815621
16303743
16381901
19047084
19056885
21136834
21625861
21925246
21945643
22685421

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0007267  cell-cell signaling
GO:0030517  negative regulation of axon extension
GO:0007399  nervous system development
GO:0031290  retinal ganglion cell axon guidance

Cellular Component

GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0016020  membrane
GO:0005886  plasma membrane
GO:0045211  postsynaptic membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity