sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3C

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同義遺伝子名

Semaphorin-3C precursor, SEMA3C, SEMAE, Sema E, Semaphorin E, SemE

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:75.80 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:116.60 松果体:- 末梢神経:122.70 脊柱:336.90 網膜:118.60 目:47 動脈:60 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:56.70 胸腺:- 骨髄:59 脂肪:- 骨:255.90 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:5.18 小脳:4.03 脳幹:6.23 脳梁:5.90 松果体:- 末梢神経:6.80 脊柱:5.91 網膜:- 目:- 動脈:6.93 静脈:7.43 リンパ節:3.71 末梢血:- 脾臓:6.38 胸腺:3.87 骨髄:3.68 脂肪:8.13 骨:- 皮膚:7.12
CAGE 大脳:2.65 小脳:- 脳幹:4.20 脳梁:3.39 松果体:2.72 末梢神経:- 脊柱:3.24 網膜:- 目:- 動脈:4.30 静脈:3.89 リンパ節:1.55 末梢血:- 脾臓:3.39 胸腺:1.10 骨髄:- 脂肪:4.57 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.86 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.17 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.31 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:127.60 胎盤:18.20 前立腺:146.40 卵巣:- 精巣:86.50 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:97.20 結腸:101.80     肝臓:31.70        肺:127.10    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:176.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.25 胎盤:4.74 前立腺:8.96 卵巣:7.78 精巣:6.20 心臓:7.19 骨格筋:7.33 食道:5.39 胃:7.12 腸:6.80 結腸:6.06 肝臓:3.66 肺:6.54 膀胱:- 腎臓:4.92 下垂体:4.14 甲状腺:4.48 副腎:5.49 膵臓:3.57 乳腺:7.90 唾液腺:6.31
CAGE 子宮:4.78 胎盤:3.04 前立腺:4.44 卵巣:4.32 精巣:3.78 心臓:4.09 骨格筋:2.65 食道:4.24 胃:- 腸:3.62 結腸:4.22     肝臓:0.78    肺:3.77 膀胱:4.83 腎臓:3.05 下垂体:2.46 甲状腺:1.64 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:4.07 唾液腺:4.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.06 卵巣:4.10 精巣:4.15 心臓:3.36 骨格筋:1.79 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.44     肝臓:0.25        肺:4.70    膀胱:- 腎臓:2.72 下垂体:- 甲状腺:2.84 副腎:1.26 膵臓:- 乳腺:6.40 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_006379
Gene ID 10512
Unigene ID Hs.269109
Probe set ID 203789_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000075223
GTEx ID ENSG00000075223

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_013657
ラット[1]  NM_001106578

染色体

7q21.11  [80,371,854  -  80,551,675]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7748561
7829101
8889548
9168980
9331348
9405678
12174914
12477932
12690205
12730958
12853948
15077297
15146197
15489334
15609325
17390026
19414484
19666519
19915008
22899844
22924992
23666167

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0001974  blood vessel remodeling
GO:0003215  cardiac right ventricle morphogenesis
GO:0060666  dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching
GO:0006955  immune response
GO:0060174  limb bud formation
GO:0001755  neural crest cell migration
GO:0021915  neural tube development
GO:0003151  outflow tract morphogenesis
GO:0009791  post-embryonic development
GO:0003350  pulmonary myocardium development
GO:0042493  response to drug
GO:0001756  somitogenesis

Cellular Component

GO:0005615  extracellular space
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity
GO:0030215  semaphorin receptor binding