PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, PRP8, Splicing factor Prp8, PRPF8, HPRP8, 220 kDa U5 snRNP-specific protein, PRP8 homolog, PRPC8, RP13, p220

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:119.70

小脳:151.10

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:148.30

末梢神経:184

脊柱:336.90

網膜:237.30

目:235.10

動脈:60

静脈:733.10

リンパ節:171.90

末梢血:72.90

脾臓:94.50

胸腺:116

骨髄:334.60

脂肪:40.30

骨:76.80

皮膚:326.40

GeneChip

大脳:8.08

小脳:8.70

脳幹:8.14

脳梁:8.08

松果体:-

末梢神経:8.36

脊柱:7.96

網膜:-

目:-

動脈:8.35

静脈:7.93

リンパ節:8.70

末梢血:-

脾臓:8.62

胸腺:8.86

骨髄:8.21

脂肪:8.45

骨:-

皮膚:8.69

CAGE

大脳:4.13

小脳:-

脳幹:4.36

脳梁:4.65

松果体:4.75

末梢神経:-

脊柱:4.04

網膜:-

目:-

動脈:4.54

静脈:4.17

リンパ節:4.58

末梢血:-

脾臓:4.44

胸腺:5.02

骨髄:-

脂肪:4.49

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.18

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:160.30

前立腺:259.10

卵巣:559

精巣:151.40

心臓:114.90

骨格筋:80.40

食道:-

胃:552.30

腸:32.40

結腸:347.70

肝臓:84.40

肺:83.10

膀胱:-

腎臓:41.60

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:142.30

乳腺:650.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.76

胎盤:8.20

前立腺:8.91

卵巣:9.14

精巣:9.26

心臓:8.11

骨格筋:8.64

食道:8.68

胃:8.21

腸:8.16

結腸:8.37

肝臓:7.89

肺:8.53

膀胱:-

腎臓:8.17

下垂体:9.15

甲状腺:8.70

副腎:8.72

膵臓:7.91

乳腺:8.88

唾液腺:8.16

CAGE

子宮:4.65

胎盤:4.41

前立腺:4.55

卵巣:4.89

精巣:4.90

心臓:4.39

骨格筋:4.37

食道:4.47

胃:-

腸:4.35

結腸:4.29

肝臓:4.44

肺:4.38

膀胱:4.54

腎臓:4.07

下垂体:4.52

甲状腺:4.42

副腎:-

膵臓:4.13

乳腺:4.14

唾液腺:4.65

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.44

卵巣:5.79

精巣:5.49

心臓:4.45

骨格筋:6.11

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.76

肝臓:3.91

肺:4.96

膀胱:-

腎臓:4.62

下垂体:-

甲状腺:5.33

副腎:4.92

膵臓:-

乳腺:4.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006445
Gene ID	10594
Unigene ID	Hs.181368
Probe set ID	200000_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000174231
GTEx ID	ENSG00000174231

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_138659
ラット [0]

染色体

17p13.3 [1,553,923 - 1,588,154]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005682	U5 snRNP

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0030623	U5 snRNA binding
GO:0017070	U6 snRNA binding

PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function