TAF6-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor, 65kDa

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同義遺伝子名

PCAF-associated factor 65 alpha, PAF65A, FLJ11136, TAF6L, PAF65-alpha, MGC4288

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.76 小脳:5.91 脳幹:5.76 脳梁:5.81 松果体:- 末梢神経:5.67 脊柱:5.73 網膜:- 目:- 動脈:5.82 静脈:5.94 リンパ節:5.72 末梢血:- 脾臓:5.68 胸腺:5.82 骨髄:5.92 脂肪:5.97 骨:- 皮膚:5.93
CAGE 大脳:1.44 小脳:- 脳幹:1.79 脳梁:1.94 松果体:0.61 末梢神経:- 脊柱:1.33 網膜:- 目:- 動脈:1.16 静脈:1.83 リンパ節:1.45 末梢血:- 脾臓:1.82 胸腺:1.52 骨髄:- 脂肪:1.44 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.76 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.70 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.63 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.81 胎盤:5.73 前立腺:5.62 卵巣:5.74 精巣:5.66 心臓:5.72 骨格筋:5.87 食道:5.70 胃:5.66 腸:5.97 結腸:6.04 肝臓:5.79 肺:5.76 膀胱:- 腎臓:5.77 下垂体:6.11 甲状腺:5.74 副腎:5.82 膵臓:5.88 乳腺:5.80 唾液腺:5.78
CAGE 子宮:1.80 胎盤:1.76 前立腺:1.66 卵巣:1.72 精巣:1.26 心臓:1.29 骨格筋:1.50 食道:1.29 胃:- 腸:1.41 結腸:1.42     肝臓:2.07    肺:1.35 膀胱:1.18 腎臓:1.81 下垂体:1.86 甲状腺:1.89 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:2.11 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.22 卵巣:2.37 精巣:2.22 心臓:1.20 骨格筋:2.18 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.14     肝臓:2.20        肺:1.06    膀胱:- 腎臓:2.57 下垂体:- 甲状腺:3.10 副腎:2.62 膵臓:- 乳腺:2.06 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006473
Gene ID 10629
Unigene ID -
Probe set ID 213209_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000162227
GTEx ID ENSG00000162227

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001177798, NM_146092
ラット[1]  NM_001107575, NM_146092

染色体

11q12.3  [62,538,775  -  62,554,814]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009072  Histone-fold
IPR004823  TATA box binding protein associated factor (TAF)

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9674419
9674425
9885574
11406595
11564863
12477932
12601814
12660246
14702039
15489334
15964547
16189514
16713569
17643375
18400184
18714023
19615732
21139048
21906983
21963094
21988832
23383273
23667531
24778252

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0043966  histone H3 acetylation
GO:0051090  regulation of transcription factor activity
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006352  transcription initiation

Cellular Component

GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0030914  STAGA complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0004402  histone acetyltransferase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0003713  transcription coactivator activity