lysine (K)-specific demethylase 5B

同義遺伝子名

FLJ23670, FLJ12491, RBBP2H1A, PLU-1, jumonji, AT rich interactive domain 1B, FLJ12459, FLJ10538, FLJ16281, JARID1B, PUT1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:132.70

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:175

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:355.90

目:123.40

動脈:60

静脈:199.90

リンパ節:50.60

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:167.50

骨髄:98.40

脂肪:40.30

骨:38.40

皮膚:48

GeneChip

大脳:6.08

小脳:6.52

脳幹:5.87

脳梁:5.94

松果体:-

末梢神経:6.40

脊柱:6.04

網膜:-

目:-

動脈:6.39

静脈:6.50

リンパ節:6.42

末梢血:-

脾臓:6.46

胸腺:6.86

骨髄:6.70

脂肪:6.64

骨:-

皮膚:7.32

CAGE

大脳:3.67

小脳:-

脳幹:3.04

脳梁:3.33

松果体:5.37

末梢神経:-

脊柱:3.43

網膜:-

目:-

動脈:3.85

静脈:3.66

リンパ節:3.65

末梢血:-

脾臓:3.48

胸腺:4.63

骨髄:-

脂肪:3.37

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.14

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.85

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.04

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:127.60

胎盤:87.40

前立腺:101.40

卵巣:74.50

精巣:449.90

心臓:178.80

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:32.40

結腸:110.20

肝臓:42.20

肺:171.10

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:232

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:-

乳腺:185.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.47

胎盤:7.45

前立腺:7.36

卵巣:7.41

精巣:9.13

心臓:6.06

骨格筋:6.13

食道:7.53

胃:6.53

腸:6.24

結腸:6.73

肝臓:5.90

肺:6.40

膀胱:-

腎臓:6.33

下垂体:6.26

甲状腺:6.60

副腎:6.32

膵臓:6.39

乳腺:7.62

唾液腺:6.54

CAGE

子宮:4.27

胎盤:4.63

前立腺:4.11

卵巣:4.19

精巣:5.69

心臓:3.51

骨格筋:2.90

食道:4.22

胃:-

腸:3.31

結腸:4.21

肝臓:2.77

肺:3.85

膀胱:4.12

腎臓:3.32

下垂体:3.74

甲状腺:3.76

副腎:-

膵臓:3.75

乳腺:4.16

唾液腺:4.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.39

卵巣:3.66

精巣:5.59

心臓:1.73

骨格筋:1.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.95

肝臓:1.50

肺:3.28

膀胱:-

腎臓:2.52

下垂体:-

甲状腺:3.19

副腎:2.46

膵臓:-

乳腺:2.80

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006618
Gene ID	10765
Unigene ID	Hs.443650
Probe set ID	211202_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000117139
GTEx ID	ENSG00000117139

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_152895
ラット[1]	NM_001107177

染色体

1q32.1 [202,696,526 - 202,778,598]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0034721	histone H3-K4 demethylation, trimethyl-H3-K4-specific
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0034648	histone demethylase activity (H3-dimethyl-K4 specific)
GO:0034647	histone demethylase activity (H3-trimethyl-K4 specific)
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515	protein binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function