AT rich interactive domain 5A (MRF1-like)

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同義遺伝子名

AT rich interactive domain 5A (MRF1-like), MRF-1, ARID5A, RP11-363D14

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:41.50 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:296.70 末梢神経:30.70 脊柱:224.60 網膜:- 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:25.80 骨髄:98.40 脂肪:- 骨:- 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:6.22 小脳:6.09 脳幹:6.34 脳梁:6.22 松果体:- 末梢神経:6.17 脊柱:6.25 網膜:- 目:- 動脈:7.66 静脈:7.99 リンパ節:7.05 末梢血:- 脾臓:6.77 胸腺:6.85 骨髄:6.49 脂肪:6.76 骨:- 皮膚:6.32
CAGE 大脳:2.91 小脳:- 脳幹:2.98 脳梁:2.65 松果体:2.47 末梢神経:- 脊柱:3.80 網膜:- 目:- 動脈:5.04 静脈:4.03 リンパ節:3.96 末梢血:- 脾臓:3.50 胸腺:3.32 骨髄:- 脂肪:3.97 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.44 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.64 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.67 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:21.90 前立腺:56.30 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:51.10 骨格筋:- 食道:- 胃:85 腸:- 結腸:59.40     肝臓:10.60        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:44.50 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.75 胎盤:5.94 前立腺:6.48 卵巣:6.33 精巣:6.03 心臓:6.68 骨格筋:6.76 食道:6.21 胃:6.40 腸:6.39 結腸:6.76 肝臓:6.74 肺:7.72 膀胱:- 腎臓:6.09 下垂体:6.05 甲状腺:6.34 副腎:6.32 膵臓:6.83 乳腺:7.32 唾液腺:6.29
CAGE 子宮:3.62 胎盤:2.51 前立腺:3.71 卵巣:3.41 精巣:2.80 心臓:3.92 骨格筋:3.46 食道:3.21 胃:- 腸:2.40 結腸:3.04     肝臓:1.81    肺:3.89 膀胱:3.91 腎臓:2.05 下垂体:2.33 甲状腺:2.45 副腎:- 膵臓:1.59 乳腺:4.15 唾液腺:2.63
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.12 卵巣:2.56 精巣:3.08 心臓:2.48 骨格筋:3.81 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.05     肝臓:2.16        肺:5.75    膀胱:- 腎臓:1.77 下垂体:- 甲状腺:2.77 副腎:4.65 膵臓:- 乳腺:3.53 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_212481
Gene ID 10865
Unigene ID Hs.92033
Probe set ID 213138_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000196843
GTEx ID ENSG00000196843

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001172205, NM_001172206, NM_145996
ラット[1]  NM_001034934, NM_001172206, NM_145996

染色体

2q11.2  [97,202,480  -  97,218,375]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8649988
8889548
12477932
12975309
15640446
15941852
16713569
18029348
18854154
21184583
21890473
22797925
23000965
23275563

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0002062  chondrocyte differentiation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0035066  positive regulation of histone acetylation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008134  transcription factor binding