CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

ATP/GTP-binding protein, hClp1, HEAB

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:3.60 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:36.40 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:201.70 骨:89.60 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:5.88 小脳:6.11 脳幹:5.71 脳梁:5.88 松果体:- 末梢神経:6.13 脊柱:5.97 網膜:- 目:- 動脈:6.05 静脈:5.91 リンパ節:6.36 末梢血:- 脾臓:6.54 胸腺:6.50 骨髄:6.63 脂肪:6.38 骨:- 皮膚:6.76
CAGE 大脳:1.30 小脳:- 脳幹:1.44 脳梁:1.34 松果体:1.00 末梢神経:- 脊柱:1.39 網膜:- 目:- 動脈:1.68 静脈:2.06 リンパ節:1.74 末梢血:- 脾臓:2.11 胸腺:2.01 骨髄:- 脂肪:1.84 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.97 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.56 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.23 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:18.20 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:76.60 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:10.60        肺:14.70    膀胱:125.60 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.49 胎盤:7.14 前立腺:6.41 卵巣:6.66 精巣:6.91 心臓:5.89 骨格筋:6.37 食道:6.58 胃:6.37 腸:6.26 結腸:6.62 肝臓:6.37 肺:6.33 膀胱:- 腎臓:6.24 下垂体:6.25 甲状腺:6.32 副腎:6.20 膵臓:6.06 乳腺:6.72 唾液腺:6.25
CAGE 子宮:1.74 胎盤:2.20 前立腺:1.88 卵巣:1.35 精巣:1.77 心臓:1.63 骨格筋:1.78 食道:1.48 胃:- 腸:1.86 結腸:1.50     肝臓:1.86    肺:1.54 膀胱:1.45 腎臓:1.73 下垂体:1.18 甲状腺:1.86 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:1.68 唾液腺:1.67
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.86 卵巣:0.51 精巣:0.97 心臓:0.59 骨格筋:2.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.26     肝臓:0.87        肺:0.70    膀胱:- 腎臓:0.87 下垂体:- 甲状腺:0.68 副腎:1.29 膵臓:- 乳腺:0.46 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001142597
Gene ID 10978
Unigene ID Hs.523687
Probe set ID 204370_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000172409
GTEx ID ENSG00000172409

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_133840
ラット[1]  NM_001009599

染色体

11q12.1  [57,416,465  -  57,429,340]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8896421
11060040
11384994
12226669
12477932
15109492
15489334
16344560
17495927
18648070
19471022
20360068
21139048
21832049
21906983
21963094
24250222
24766809
24766810
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0035087  siRNA loading onto RISC involved in RNA interference
GO:0030423  targeting of mRNA for destruction involved in RNA interference
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006388  tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation

Cellular Component

GO:0005654  nucleoplasm
GO:0000214  tRNA-intron endonuclease complex

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0046404  ATP-dependent polydeoxyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity
GO:0051736  ATP-dependent polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity
GO:0051733  polydeoxyribonucleotide kinase activity