COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 5 (Arabidopsis)

同義遺伝子名

COPS5, Signalosome subunit 5, Jun activation domain-binding protein 1, SGN5, CSN5, COP9 signalosome complex subunit 5, MGC3149, JAB1, MOV-34

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:91.30

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:94

動脈:119.90

静脈:133.30

リンパ節:40.40

末梢血:54.70

脾臓:75.60

胸腺:90.20

骨髄:19.70

脂肪:121

骨:12.80

皮膚:100.80

GeneChip

大脳:7.89

小脳:7.26

脳幹:8.25

脳梁:7.82

松果体:-

末梢神経:8.28

脊柱:7.92

網膜:-

目:-

動脈:7.22

静脈:7.53

リンパ節:7.15

末梢血:-

脾臓:7.21

胸腺:8.40

骨髄:7.26

脂肪:7.55

骨:-

皮膚:7.39

CAGE

大脳:4.21

小脳:-

脳幹:4.28

脳梁:3.65

松果体:4.01

末梢神経:-

脊柱:4.42

網膜:-

目:-

動脈:3.56

静脈:3.83

リンパ節:3.49

末梢血:-

脾臓:3.50

胸腺:3.65

骨髄:-

脂肪:3.58

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.69

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.58

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.24

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:54.60

前立腺:101.40

卵巣:-

精巣:229.30

心臓:102.20

骨格筋:180.80

食道:-

胃:42.50

腸:64.80

結腸:42.40

肝臓:21.10

肺:107.50

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:115.60

乳腺:37.20

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:7.78

胎盤:7.92

前立腺:8.02

卵巣:7.87

精巣:8.88

心臓:8.28

骨格筋:9.01

食道:7.98

胃:7.20

腸:7.76

結腸:7.16

肝臓:7.30

肺:7.30

膀胱:-

腎臓:7.38

下垂体:7.43

甲状腺:7.41

副腎:7.62

膵臓:7.48

乳腺:7.50

唾液腺:7.73

CAGE

子宮:3.61

胎盤:3.87

前立腺:3.51

卵巣:3.31

精巣:4.10

心臓:4.37

骨格筋:4.32

食道:3.71

胃:-

腸:3.79

結腸:3.74

肝臓:3.83

肺:3.63

膀胱:3.48

腎臓:3.88

下垂体:4.09

甲状腺:3.53

副腎:-

膵臓:3.57

乳腺:4.19

唾液腺:3.90

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.95

卵巣:4.74

精巣:5.76

心臓:5.52

骨格筋:5.38

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.76

肝臓:4.62

肺:4.25

膀胱:-

腎臓:5.04

下垂体:-

甲状腺:5.18

副腎:4.08

膵臓:-

乳腺:4.84

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006837
Gene ID	10987
Unigene ID	Hs.491912
Probe set ID	201652_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000121022
GTEx ID	ENSG00000121022

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013715
ラット[1]	NM_001025695

染色体

8q13.1 [67,955,314 - 67,996,018]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010388	cullin deneddylation
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000338	protein deneddylation
GO:0006508	proteolysis
GO:0051726	regulation of cell cycle
GO:0046328	regulation of JNK cascade
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006412	translation
GO:0006413	translational initiation

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005852	eukaryotic translation initiation factor 3 complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0008180	signalosome

Molecular Function

GO:0046872	metal ion binding
GO:0008237	metallopeptidase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003743	translation initiation factor activity

COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 5 (Arabidopsis)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function