cleavage and polyadenylation specific factor 6, 68kDa

同義遺伝子名

CPSF 68 kDa subunit, HPBRII-7, Cleavage and polyadenylation specificity factor 6, CFIM, Pre-mRNA cleavage factor Im 68 kDa subunit, HPBRII-4, Protein HPBRII-4/7, CFIM68, CPSF6

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:68.70

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:76.40

動脈:119.90

静脈:66.60

リンパ節:121.30

末梢血:127.50

脾臓:170.20

胸腺:180.40

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:64

皮膚:96

GeneChip

大脳:5.11

小脳:5.38

脳幹:5.16

脳梁:5.02

松果体:-

末梢神経:5

脊柱:4.94

網膜:-

目:-

動脈:5.07

静脈:5.35

リンパ節:4.88

末梢血:-

脾臓:5.01

胸腺:5.46

骨髄:5.37

脂肪:5.05

骨:-

皮膚:4.96

CAGE

大脳:4.43

小脳:-

脳幹:4.31

脳梁:4.30

松果体:4.70

末梢神経:-

脊柱:4.24

網膜:-

目:-

動脈:4.04

静脈:3.94

リンパ節:3.90

末梢血:-

脾臓:3.95

胸腺:4.64

骨髄:-

脂肪:3.87

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.36

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.74

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.87

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:164

胎盤:58.30

前立腺:78.90

卵巣:37.30

精巣:116.80

心臓:140.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:85

腸:129.60

結腸:50.90

肝臓:105.60

肺:78.20

膀胱:-

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:253.90

膵臓:44.50

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.24

胎盤:5.16

前立腺:5.10

卵巣:5.06

精巣:4.85

心臓:5.32

骨格筋:5.49

食道:4.83

胃:5.26

腸:5.08

結腸:5.27

肝臓:4.78

肺:4.87

膀胱:-

腎臓:5.04

下垂体:4.86

甲状腺:4.89

副腎:5.10

膵臓:4.90

乳腺:4.99

唾液腺:5.10

CAGE

子宮:4.37

胎盤:3.89

前立腺:4.05

卵巣:4.17

精巣:4.17

心臓:3.78

骨格筋:3.76

食道:3.65

胃:-

腸:3.75

結腸:3.89

肝臓:3.66

肺:4.05

膀胱:4.15

腎臓:3.78

下垂体:4.53

甲状腺:4.03

副腎:-

膵臓:3.73

乳腺:3.90

唾液腺:3.97

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.47

卵巣:3.95

精巣:3.62

心臓:2.17

骨格筋:2.81

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.96

肝臓:2.11

肺:2.73

膀胱:-

腎臓:3.44

下垂体:-

甲状腺:2.81

副腎:3.36

膵臓:-

乳腺:3.13

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_007007
Gene ID	11052
Unigene ID	Hs.369606
Probe set ID	202470_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000111605
GTEx ID	ENSG00000111605

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001013391
ラット[1]	NM_001106785

染色体

12q15 [69,633,317 - 69,668,138]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006378	mRNA polyadenylation
GO:0006397	mRNA processing
GO:0051262	protein tetramerization

Cellular Component

GO:0005849	mRNA cleavage factor complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0042382	paraspeckles
GO:0030529	ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0003729	mRNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

cleavage and polyadenylation specific factor 6, 68kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function