chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39)

同義遺伝子名

GP-39, HCgp-39, Cartilage glycoprotein 39, chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39), YKL-40, Chitinase-3-like protein 1 precursor, YYL-40, CHI3L1, 39 kDa synovial protein, HC-gp39, HCGP-3P, YKL40, GP39

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:56.90

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:118.60

目:141

動脈:-

静脈:266.60

リンパ節:-

末梢血:15540.50

脾臓:75.60

胸腺:51.50

骨髄:531.40

脂肪:121

骨:2623

皮膚:144

GeneChip

大脳:6.50

小脳:4.82

脳幹:7.46

脳梁:6

松果体:-

末梢神経:4.36

脊柱:7.13

網膜:-

目:-

動脈:4.51

静脈:4.79

リンパ節:5.42

末梢血:-

脾臓:4.94

胸腺:4.88

骨髄:10.09

脂肪:5.85

骨:-

皮膚:7.82

CAGE

大脳:4.16

小脳:-

脳幹:5.01

脳梁:4.10

松果体:4.06

末梢神経:-

脊柱:5.19

網膜:-

目:-

動脈:2.30

静脈:2.16

リンパ節:4.27

末梢血:-

脾臓:2.51

胸腺:2.49

骨髄:-

脂肪:5.40

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.94

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.75

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.73

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:29.10

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:342.80

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:10.60

肺:48.90

膀胱:125.60

腎臓:31.20

下垂体:463.90

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:-

乳腺:120.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.50

胎盤:4.70

前立腺:4.40

卵巣:6.42

精巣:3.82

心臓:6.07

骨格筋:4.39

食道:5.10

胃:5.38

腸:4.87

結腸:4.85

肝臓:7.11

肺:6.07

膀胱:-

腎臓:6.56

下垂体:5.28

甲状腺:4.45

副腎:4.29

膵臓:5.75

乳腺:7.93

唾液腺:5.24

CAGE

子宮:2.40

胎盤:3.01

前立腺:2.98

卵巣:3.99

精巣:2.73

心臓:2.79

骨格筋:2.66

食道:2.99

胃:-

腸:0.69

結腸:1.66

肝臓:8.07

肺:3.84

膀胱:4.71

腎臓:3.98

下垂体:4.97

甲状腺:2.72

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:4.03

唾液腺:3.30

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.54

卵巣:3.26

精巣:5.05

心臓:1.27

骨格筋:2.72

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.48

肝臓:8.76

肺:3.37

膀胱:-

腎臓:5.07

下垂体:-

甲状腺:4.27

副腎:3.58

膵臓:-

乳腺:4.73

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001276
Gene ID	1116
Unigene ID	Hs.382202
Probe set ID	209395_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000133048
GTEx ID	ENSG00000133048

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_007695
ラット[1]	NM_053560

染色体

1q32.1 [203,148,059 - 203,155,877]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011583	Chitinase II
IPR017853	Glycoside hydrolase, catalytic core
IPR001223	Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain
IPR013781	Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007250	activation of NF-kappaB-inducing kinase activity
GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0051216	cartilage development
GO:0071356	cellular response to tumor necrosis factor
GO:0006032	chitin catabolic process
GO:0006954	inflammatory response
GO:0030324	lung development
GO:0045766	positive regulation of angiogenesis
GO:0070374	positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
GO:0010800	positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0051897	positive regulation of protein kinase B signaling cascade
GO:0070555	response to interleukin-1
GO:0070741	response to interleukin-6
GO:0009612	response to mechanical stimulus
GO:0034612	response to tumor necrosis factor

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005615	extracellular space
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0008061	chitin binding
GO:0004568	chitinase activity
GO:0005201	extracellular matrix structural constituent

chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function