polynucleotide kinase 3'-phosphatase

同義遺伝子名

polynucleotide kinase 3'-phosphatase, Polynucleotide kinase-3'-phosphatase, PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, PNK, DNA 5'-kinase/3'-phosphatase

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:24.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:23.50

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:72.90

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:5.43

小脳:5.14

脳幹:5.59

脳梁:5.36

松果体:-

末梢神経:5.71

脊柱:5.23

網膜:-

目:-

動脈:5.70

静脈:5.54

リンパ節:6.34

末梢血:-

脾臓:6.05

胸腺:5.89

骨髄:5.77

脂肪:5.77

骨:-

皮膚:5.86

CAGE

大脳:2.64

小脳:-

脳幹:2.82

脳梁:2.98

松果体:2.71

末梢神経:-

脊柱:2.62

網膜:-

目:-

動脈:2.73

静脈:3.28

リンパ節:3.13

末梢血:-

脾臓:2.92

胸腺:3.03

骨髄:-

脂肪:2.57

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.93

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.90

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.76

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:21.90

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:17.30

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:67.80

肝臓:42.20

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.63

胎盤:5.72

前立腺:6.09

卵巣:5.84

精巣:6.49

心臓:5.61

骨格筋:5.12

食道:6.10

胃:5.80

腸:5.73

結腸:5.75

肝臓:5.57

肺:5.63

膀胱:-

腎臓:6.10

下垂体:6.63

甲状腺:6.25

副腎:6.98

膵臓:5.67

乳腺:6.15

唾液腺:6.23

CAGE

子宮:2.84

胎盤:2.90

前立腺:2.83

卵巣:2.72

精巣:3.01

心臓:2.94

骨格筋:2.60

食道:2.74

胃:-

腸:2.77

結腸:3.14

肝臓:2.74

肺:2.92

膀胱:2.46

腎臓:2.73

下垂体:3.19

甲状腺:2.73

副腎:-

膵臓:3.10

乳腺:2.74

唾液腺:2.99

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.88

卵巣:3.10

精巣:3.15

心臓:1.75

骨格筋:2.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.81

肝臓:2.37

肺:2.52

膀胱:-

腎臓:2.80

下垂体:-

甲状腺:3.18

副腎:3.62

膵臓:-

乳腺:2.62

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_007254
Gene ID	11284
Unigene ID	Hs.78016
Probe set ID	218961_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000039650
GTEx ID	ENSG00000039650

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_021549
ラット[1]	NM_001004259

染色体

19q13.33 [50,364,462 - 50,370,818]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006551	DNA 3-phosphatase
IPR006549	HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIIA
IPR013954	Polynucleotide kinase 3 phosphatase, central region
IPR015636	Polynucleotide kinase 3, phosphatase
IPR006550	Polynucleotide kinase 3-phosphatase

GO:0016311	dephosphorylation
GO:0042769	DNA damage response, detection of DNA damage
GO:0006281	DNA repair
GO:0006261	DNA-dependent DNA replication
GO:0046939	nucleotide phosphorylation
GO:0000718	nucleotide-excision repair, DNA damage removal
GO:0006979	response to oxidative stress
GO:0009314	response to radiation

GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

GO:0005524	ATP binding
GO:0046404	ATP-dependent polydeoxyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0004519	endonuclease activity
GO:0019201	nucleotide kinase activity
GO:0046403	polynucleotide 3'-phosphatase activity
GO:0017076	purine nucleotide binding

polynucleotide kinase 3'-phosphatase

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function