lysosomal trafficking regulator

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同義遺伝子名

Beige homolog, Lysosomal-trafficking regulator, CHS, LYST, lysosomal trafficking regulator, Chediak-Higashi syndrome 1, CHS1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:28.40 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:118.60 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:54.70 脾臓:113.40 胸腺:193.30 骨髄:570.70 脂肪:80.70 骨:- 皮膚:144
GeneChip 大脳:6.90 小脳:7.22 脳幹:6.70 脳梁:6.88 松果体:- 末梢神経:7.31 脊柱:6.72 網膜:- 目:- 動脈:7.22 静脈:7.23 リンパ節:7.52 末梢血:- 脾臓:8.57 胸腺:8.81 骨髄:8.69 脂肪:7.33 骨:- 皮膚:6.71
CAGE 大脳:2.95 小脳:- 脳幹:2.93 脳梁:2.65 松果体:4.16 末梢神経:- 脊柱:3.07 網膜:- 目:- 動脈:2.76 静脈:3.18 リンパ節:2.96 末梢血:- 脾臓:3.13 胸腺:4.20 骨髄:- 脂肪:3.59 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.49 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.56 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.21 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:36.40 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:77.90 心臓:38.30 骨格筋:20.10 食道:- 胃:21.20 腸:64.80 結腸:17     肝臓:21.10        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:62.20 乳腺:55.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.90 胎盤:6.27 前立腺:6.66 卵巣:6.64 精巣:6.78 心臓:6.86 骨格筋:6.44 食道:6.95 胃:7.73 腸:6.48 結腸:6.80 肝臓:7.38 肺:8 膀胱:- 腎臓:6.75 下垂体:6.94 甲状腺:6.90 副腎:7.32 膵臓:6.45 乳腺:7.46 唾液腺:6.64
CAGE 子宮:3.14 胎盤:2.54 前立腺:2.91 卵巣:2.55 精巣:2.67 心臓:2.51 骨格筋:2.05 食道:2.76 胃:- 腸:2.21 結腸:2.74     肝臓:2.63    肺:3.36 膀胱:3.06 腎臓:2.05 下垂体:2.90 甲状腺:2.51 副腎:- 膵臓:1.59 乳腺:3.40 唾液腺:2.06
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.23 卵巣:1.68 精巣:2.21 心臓:1.02 骨格筋:0.85 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.91     肝臓:1.03        肺:2.43    膀胱:- 腎臓:1.34 下垂体:- 甲状腺:1.24 副腎:1.72 膵臓:- 乳腺:1.61 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_000081
Gene ID 1130
Unigene ID Hs.532411
Probe set ID 210943_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143669
GTEx ID ENSG00000143669

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_010748
ラット[1]  NM_010748

染色体

1q42.3  [235,824,341  -  236,046,940]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1672300
3013924
3322007
6154765
6445041
8717042
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8751864
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9215679
9215680
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12125812
12446740
12477932
12753649
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16710414
18043242
19620308
20301751
20463881
21139048
21488161
21890473
24072239

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007596  blood coagulation
GO:0042742  defense response to bacterium
GO:0042832  defense response to protozoan
GO:0051607  defense response to virus
GO:0032510  endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway
GO:0030595  leukocyte chemotaxis
GO:0007040  lysosome organization
GO:0033364  mast cell secretory granule organization
GO:0032438  melanosome organization
GO:0007017  microtubule-based process
GO:0042267  natural killer cell mediated cytotoxicity
GO:0002446  neutrophil mediated immunity
GO:0055091  phospholipid homeostasis
GO:0006644  phospholipid metabolic process
GO:0043473  pigmentation
GO:0032816  positive regulation of natural killer cell activation
GO:0042493  response to drug
GO:0033299  secretion of lysosomal enzymes
GO:0002456  T cell mediated immunity

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0015630  microtubule cytoskeleton

Molecular Function

GO:0005515  protein binding