synaptopodin

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同義遺伝子名

KIAA1029, synaptopodin, SYNPO, Synaptopodin

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:4.76

小脳:-

脳幹:3.59

脳梁:3.45

松果体:3.92

末梢神経:-

脊柱:3.97

網膜:-

目:-

動脈:6.31

静脈:4.50

リンパ節:3.71

末梢血:-

脾臓:4.57

胸腺:2.48

骨髄:-

脂肪:5.01

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.95

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.74

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.12

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:4.26

胎盤:5.15

前立腺:4.83

卵巣:5.20

精巣:4.44

心臓:6.10

骨格筋:6.39

食道:4.34

胃:-

腸:3.72

結腸:3.83

肝臓:4.21

肺:4.87

膀胱:4.92

腎臓:4.42

下垂体:3.38

甲状腺:4.23

副腎:-

膵臓:3.98

乳腺:3.97

唾液腺:3.09

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.52

卵巣:1.00

精巣:2.70

心臓:6.67

骨格筋:8.44

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.41

肝臓:0.90

肺:3.00

膀胱:-

腎臓:0.94

下垂体:-

甲状腺:5.71

副腎:1.63

膵臓:-

乳腺:4.13

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001109974
Gene ID	11346
Unigene ID	-
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000171992
GTEx ID	ENSG00000171992

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001109975, NM_177340
ラット [0]

染色体

5q33.1 [149,980,642 - 150,038,782]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0032233	positive regulation of actin filament bundle formation
GO:0051492	regulation of stress fiber formation

Cellular Component

GO:0015629	actin cytoskeleton
GO:0005737	cytoplasm
GO:0043197	dendritic spine
GO:0043204	perikaryon
GO:0005886	plasma membrane
GO:0014069	postsynaptic density
GO:0045211	postsynaptic membrane
GO:0001725	stress fiber
GO:0005923	tight junction

Molecular Function

GO:0003779	actin binding
GO:0005515	protein binding

synaptopodin

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function