peptidoglycan recognition protein 2

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同義遺伝子名

Peptidoglycan recognition protein 2, PGRPL, peptidoglycan recognition protein 2, tagL-alpha, PGLYRPL, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase precursor, Peptidoglycan recognition protein long, tagL, PGRP-L, tagl-beta, HMFT0141, PGLYRP2, TAGL-like, UNQ3103/PRO10102

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.09 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.01 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.01 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:151.40 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:147.80        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:0.32 胎盤:0 前立腺:0 卵巣:0 精巣:2.68 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:5.12    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.55 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.04 卵巣:0.01 精巣:0.95 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:5.22        肺:0.02    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0.01 副腎:0.05 膵臓:- 乳腺:0.03 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_052890
Gene ID 114770
Unigene ID Hs.282244
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000161031
GTEx ID ENSG00000161031

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_021319
ラット[1]  NM_021319

染色体

19p13.12  [15,579,456  -  15,590,663]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002502  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2
IPR015510  Peptidoglycan recognition protein
IPR006619  Peptidoglycan recognition protein, metazoa/bacteria

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7663175
11441184
11461926
11752456
12477932
12669421
12754519
12975309
14506276
14702039
15221005
15340057
15340161
16054449
16239516
16335952
16344560
16714290
17975119
18649358
19023099
20237496

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050830  defense response to Gram-positive bacterium
GO:0016045  detection of bacterium
GO:0044117  growth of symbiont in host
GO:0045087  innate immune response
GO:0032689  negative regulation of interferon-gamma production
GO:0032827  negative regulation of natural killer cell differentiation during immune response
GO:0001519  peptide amidation
GO:0009253  peptidoglycan catabolic process

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0005622  intracellular
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0008745  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity
GO:0042834  peptidoglycan binding
GO:0016019  peptidoglycan receptor activity
GO:0008270  zinc ion binding