collagen triple helix repeat containing 1

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同義遺伝子名

NMTC1 protein, collagen triple helix repeat containing 1, UNQ762/PRO1550, CTHRC1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:60 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:24
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.35 小脳:- 脳幹:0.80 脳梁:0.24 松果体:0.48 末梢神経:- 脊柱:0.30 網膜:- 目:- 動脈:3.26 静脈:1.89 リンパ節:1.61 末梢血:- 脾臓:0.56 胸腺:0.86 骨髄:- 脂肪:2.81 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.15 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.06 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.28 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:54.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:21.10        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.41 胎盤:2.97 前立腺:1.34 卵巣:1.33 精巣:1.22 心臓:1.45 骨格筋:1.03 食道:1.26 胃:- 腸:0.90 結腸:1.33     肝臓:0    肺:1.10 膀胱:2.39 腎臓:0.82 下垂体:0.42 甲状腺:0.98 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:3.27 唾液腺:2.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.53 卵巣:0.83 精巣:1.55 心臓:0.66 骨格筋:0.69 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.06     肝臓:0.00        肺:2.10    膀胱:- 腎臓:0.67 下垂体:- 甲状腺:0.96 副腎:2.36 膵臓:- 乳腺:3.76 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_138455
Gene ID 115908
Unigene ID Hs.405614
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000164932
GTEx ID ENSG00000164932

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_026778
ラット[1]  NM_172333

染色体

8q22.3  [104,383,743  -  104,395,225]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
12975309
15340161
15489334
15618538
16778098
18467647
19730683
21791690
22590977
23222813
23274062
23359115
23703614
24370779
24746208

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016477  cell migration
GO:0090103  cochlea morphogenesis
GO:0090177  establishment of planar polarity involved in neural tube closure
GO:0060122  inner ear receptor stereocilium organization
GO:0090090  negative regulation of Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin
GO:0043932  ossification involved in bone remodeling
GO:0045669  positive regulation of osteoblast differentiation
GO:0033690  positive regulation of osteoblast proliferation
GO:0032092  positive regulation of protein binding
GO:0060071  Wnt receptor signaling pathway, planar cell polarity pathway

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005615  extracellular space

Molecular Function

GO:0005109  frizzled binding
GO:0017147  Wnt-protein binding