LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 3

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同義遺伝子名

LYSMD3, DKFZp686F0735, FLJ13542

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:3.60 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:355.90 目:29.40 動脈:30 静脈:- リンパ節:111.20 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:39.40 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:19.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.68 小脳:- 脳幹:2.96 脳梁:2.29 松果体:3.55 末梢神経:- 脊柱:2.82 網膜:- 目:- 動脈:2.84 静脈:2.67 リンパ節:3.00 末梢血:- 脾臓:3.23 胸腺:3.32 骨髄:- 脂肪:3.15 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.87 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.70 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.09 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:29.10 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:8.50     肝臓:105.60        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.32 胎盤:3.41 前立腺:3.25 卵巣:3.52 精巣:2.58 心臓:3.03 骨格筋:2.85 食道:3.08 胃:- 腸:3.42 結腸:2.60     肝臓:3.86    肺:3.31 膀胱:3.30 腎臓:3.57 下垂体:3.89 甲状腺:3.45 副腎:- 膵臓:2.18 乳腺:3.06 唾液腺:2.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.42 卵巣:4.17 精巣:3.21 心臓:3.00 骨格筋:2.48 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.54     肝臓:3.44        肺:3.63    膀胱:- 腎臓:3.96 下垂体:- 甲状腺:3.76 副腎:3.05 膵臓:- 乳腺:3.16 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198273
Gene ID 116068
Unigene ID Hs.136235
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000176018
ENSG00000259141
GTEx ID ENSG00000176018
ENSG00000259141

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_030257
ラット[1]  NM_001009698

染色体

5q14.3  [89,811,428  -  89,825,401]
5q14.3  [89,811,444  -  89,825,401]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR018392  Peptidoglycan-binding lysin domain
IPR002482  Peptidoglycan-binding Lysin subgroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11076863
11230166
12477932
14702039
15489334
15489336
16381901
17567985
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016998  cell wall macromolecule catabolic process

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane