chloride channel 3

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同義遺伝子名

ClC-3, CLCN3, chloride channel 3, Chloride channel protein 3, CLC3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:139.80 小脳:125.90 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:153.40 脊柱:336.90 網膜:118.60 目:117.50 動脈:89.90 静脈:66.60 リンパ節:91 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:38.70 骨髄:59 脂肪:80.70 骨:12.80 皮膚:201.60
GeneChip 大脳:6.97 小脳:6.58 脳幹:7.17 脳梁:7.14 松果体:- 末梢神経:6.71 脊柱:7.21 網膜:- 目:- 動脈:5.37 静脈:5.69 リンパ節:5.55 末梢血:- 脾臓:5.64 胸腺:5.63 骨髄:6.13 脂肪:5.55 骨:- 皮膚:5.69
CAGE 大脳:4.95 小脳:- 脳幹:5.10 脳梁:5.09 松果体:5.87 末梢神経:- 脊柱:5.34 網膜:- 目:- 動脈:3.60 静脈:3.36 リンパ節:3.81 末梢血:- 脾臓:3.82 胸腺:3.85 骨髄:- 脂肪:3.80 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.07 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.79 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:69.20 前立腺:123.90 卵巣:37.30 精巣:73.50 心臓:63.90 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:110.20     肝臓:84.40        肺:88    膀胱:- 腎臓:83.20 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:97.80 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.57 胎盤:6.18 前立腺:6.62 卵巣:5.84 精巣:6.55 心臓:6.34 骨格筋:5.84 食道:6.45 胃:5.92 腸:5.98 結腸:6.08 肝臓:5.76 肺:5.95 膀胱:- 腎臓:6.02 下垂体:6.52 甲状腺:5.85 副腎:6.11 膵臓:6.57 乳腺:6.09 唾液腺:7.28
CAGE 子宮:3.89 胎盤:4.20 前立腺:3.97 卵巣:3.76 精巣:4.44 心臓:4.30 骨格筋:3.68 食道:4.35 胃:- 腸:4.28 結腸:4.07     肝臓:3.76    肺:3.89 膀胱:4.08 腎臓:4.34 下垂体:5.24 甲状腺:3.87 副腎:- 膵臓:4.28 乳腺:3.24 唾液腺:5.55
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.97 卵巣:1.44 精巣:1.59 心臓:0.88 骨格筋:0.85 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.31     肝臓:0.34        肺:0    膀胱:- 腎臓:2.47 下垂体:- 甲状腺:1.74 副腎:0.52 膵臓:- 乳腺:1.34 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_173872
Gene ID 1182
Unigene ID Hs.481186
Probe set ID 201732_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000109572
GTEx ID ENSG00000109572

オーソログ対応遺伝子

マウス[30]  NM_007711, NM_173873, NM_173874, NM_173876
ラット [0]  

染色体

4q33  [170,533,784  -  170,644,824]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002245  Chloride channel CLC-3
IPR001807  Chloride channel, voltage gated

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7665160
9521585
9678416
9843494
10198195
11076863
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11274166
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11967229
12183454
12471024
12477932
12842831
12843258
15073168
15342556
15489336
15596438
16033995
16344560
16381901
16522634
17360969
17869465
17882904
17908687
17976378
17977943
18077605
18986326
19946888
20139089
20945353
21071705
21115901
21378974
21445064
21792908
22049206
22108225
22371056
22496242
23006728
23270726
23345219
23408563
23873092

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048388  endosomal lumen acidification
GO:0034220  ion transmembrane transport
GO:0006885  regulation of pH
GO:0055085  transmembrane transport
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0016324  apical plasma membrane
GO:0009986  cell surface
GO:0005769  early endosome
GO:0031901  early endosome membrane
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0000139  Golgi membrane
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005770  late endosome
GO:0031902  late endosome membrane
GO:0030658  transport vesicle membrane
GO:0012506  vesicle membrane

Molecular Function

GO:0015297  antiporter activity
GO:0005524  ATP binding
GO:0005254  chloride channel activity
GO:0030165  PDZ domain binding
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0005247  voltage-gated chloride channel activity