contactin 1

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同義遺伝子名

Contactin-1 precursor, GP135, contactin 1, Glycoprotein gp135, F3, Neural cell surface protein F3, CNTN1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:120.90

小脳:138.50

脳幹:6535.90

脳梁:58.30

松果体:148.30

末梢神経:337.40

脊柱:561.50

網膜:-

目:41.10

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:6.34

小脳:7.13

脳幹:6.57

脳梁:6.06

松果体:-

末梢神経:6.24

脊柱:7.05

網膜:-

目:-

動脈:5.60

静脈:5.32

リンパ節:5.20

末梢血:-

脾臓:5.08

胸腺:5.23

骨髄:5.60

脂肪:5.57

骨:-

皮膚:5.65

CAGE

大脳:5.01

小脳:-

脳幹:4.83

脳梁:4.52

松果体:5.03

末梢神経:-

脊柱:5.45

網膜:-

目:-

動脈:3.21

静脈:2.35

リンパ節:1.18

末梢血:-

脾臓:1.56

胸腺:0.23

骨髄:-

脂肪:0.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.58

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.43

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.36

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:18.20

前立腺:11.30

卵巣:74.50

精巣:21.60

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:10.60

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:97.80

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.47

胎盤:5.36

前立腺:5.45

卵巣:5.50

精巣:5.82

心臓:5.31

骨格筋:5.38

食道:5.22

胃:5.40

腸:5.28

結腸:5.43

肝臓:5.09

肺:5.18

膀胱:-

腎臓:5.24

下垂体:5.83

甲状腺:5.12

副腎:5.26

膵臓:5.58

乳腺:5.27

唾液腺:5.44

CAGE

子宮:2.63

胎盤:0.30

前立腺:4.08

卵巣:3.24

精巣:2.03

心臓:0.99

骨格筋:0.05

食道:2.61

胃:-

腸:1.39

結腸:1.43

肝臓:0.36

肺:1.52

膀胱:4.05

腎臓:1.82

下垂体:3.90

甲状腺:0.60

副腎:-

膵臓:1.87

乳腺:1.92

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.27

卵巣:3.63

精巣:3.49

心臓:0.08

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.16

肝臓:0.09

肺:1.86

膀胱:-

腎臓:0.41

下垂体:-

甲状腺:0.52

副腎:1.87

膵臓:-

乳腺:0.93

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001843
Gene ID	1272
Unigene ID	Hs.143434
Probe set ID	211203_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000018236
GTEx ID	ENSG00000018236

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001159647, NM_001159648, NM_007727
ラット [0]

染色体

12q12 [41,086,244 - 41,465,772]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003961	Fibronectin, type III
IPR008957	Fibronectin, type III-like fold

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0007155	cell adhesion
GO:0021549	cerebellum development
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0010976	positive regulation of neuron projection development
GO:0010765	positive regulation of sodium ion transport

Cellular Component

GO:0031225	anchored to membrane
GO:0016020	membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0030246	carbohydrate binding
GO:0001948	glycoprotein binding

contactin 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function