collagen, type III, alpha 1

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同義遺伝子名

COL3A1, EDS4A, Collagen alpha-1(III) chain precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.31

小脳:4.22

脳幹:4.47

脳梁:4.23

松果体:-

末梢神経:9.34

脊柱:5.49

網膜:-

目:-

動脈:10.26

静脈:11.20

リンパ節:8.53

末梢血:-

脾臓:9.85

胸腺:7.74

骨髄:6.11

脂肪:11.31

骨:-

皮膚:10.16

CAGE

大脳:0.69

小脳:-

脳幹:1.38

脳梁:1.38

松果体:2.90

末梢神経:-

脊柱:1.73

網膜:-

目:-

動脈:5.84

静脈:5.61

リンパ節:4.70

末梢血:-

脾臓:4.90

胸腺:3.56

骨髄:-

脂肪:5.26

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.93

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.27

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:12.50

胎盤:11.60

前立腺:9.27

卵巣:10.90

精巣:7.78

心臓:9.57

骨格筋:8.08

食道:9.35

胃:10.78

腸:10.99

結腸:10.83

肝臓:8.01

肺:8.67

膀胱:-

腎臓:7.33

下垂体:5.88

甲状腺:8.38

副腎:8.29

膵臓:8.32

乳腺:10.78

唾液腺:7.34

CAGE

子宮:7.15

胎盤:6.53

前立腺:4.89

卵巣:5.53

精巣:4.85

心臓:4.92

骨格筋:3.48

食道:4.97

胃:-

腸:4.67

結腸:5.34

肝臓:3.81

肺:4.80

膀胱:5.46

腎臓:4.14

下垂体:1.75

甲状腺:3.35

副腎:-

膵臓:4.06

乳腺:4.56

唾液腺:3.85

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.99

卵巣:7.49

精巣:6.49

心臓:4.66

骨格筋:1.41

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.15

肝臓:4.56

肺:5.33

膀胱:-

腎臓:5.35

下垂体:-

甲状腺:4.66

副腎:6.72

膵臓:-

乳腺:8.53

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000090
Gene ID	1281
Unigene ID	-
Probe set ID	201852_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000168542
GTEx ID	ENSG00000168542

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_009930
ラット [0]

染色体

2q32.2 [189,839,046 - 189,877,472]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

LRG_3 [5,001 - 43,374]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0001568	blood vessel development
GO:0007160	cell-matrix adhesion
GO:0071230	cellular response to amino acid stimulus
GO:0021987	cerebral cortex development
GO:0032964	collagen biosynthetic process
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0043206	fibril organization
GO:0048565	gut development
GO:0007507	heart development
GO:0007229	integrin-mediated signaling pathway
GO:0050777	negative regulation of immune response
GO:0018149	peptide cross-linking
GO:0030168	platelet activation
GO:0035025	positive regulation of Rho protein signal transduction
GO:0034097	response to cytokine stimulus
GO:0009314	response to radiation
GO:0001501	skeletal system development
GO:0043588	skin development
GO:0007179	transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0042060	wound healing

Cellular Component

GO:0005586	collagen type III
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0005178	integrin binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0048407	platelet-derived growth factor binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046332	SMAD binding

collagen, type III, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function