collagen, type IV, alpha 2

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同義遺伝子名

FLJ22259, DKFZp686I14213, COL4A2, collagen, type IV, alpha 2, Collagen alpha-2(IV) chain precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:33.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:398.70

脊柱:898.40

網膜:-

目:282.10

動脈:60

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:264.70

胸腺:12.90

骨髄:196.80

脂肪:564.70

骨:140.70

皮膚:115.20

GeneChip

大脳:6

小脳:5.94

脳幹:6.12

脳梁:5.37

松果体:-

末梢神経:9.40

脊柱:5.96

網膜:-

目:-

動脈:11.36

静脈:10.75

リンパ節:8.31

末梢血:-

脾臓:10.25

胸腺:6.46

骨髄:5.90

脂肪:10.71

骨:-

皮膚:9.12

CAGE

大脳:2.38

小脳:-

脳幹:2.80

脳梁:2.29

松果体:3.01

末梢神経:-

脊柱:2.85

網膜:-

目:-

動脈:6.21

静脈:4.82

リンパ節:3.80

末梢血:-

脾臓:5.54

胸腺:2.84

骨髄:-

脂肪:5.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.12

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.18

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:7.34

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:401

胎盤:488.20

前立腺:259.10

卵巣:335.40

精巣:47.60

心臓:357.60

骨格筋:60.30

食道:-

胃:106.20

腸:97.20

結腸:237.40

肝臓:95

肺:215.10

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:-

甲状腺:491.20

副腎:304.70

膵臓:160

乳腺:260.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:10.62

胎盤:11.44

前立腺:9.39

卵巣:9.68

精巣:7.61

心臓:9.72

骨格筋:7.49

食道:7.94

胃:9.81

腸:9.83

結腸:10.09

肝臓:7.32

肺:10.48

膀胱:-

腎臓:9.21

下垂体:6.54

甲状腺:9.48

副腎:9.22

膵臓:7.97

乳腺:9.99

唾液腺:8

CAGE

子宮:5.31

胎盤:6.23

前立腺:4.86

卵巣:4.75

精巣:3.89

心臓:5.05

骨格筋:4.53

食道:4.64

胃:-

腸:4.74

結腸:5.18

肝臓:3.59

肺:4.98

膀胱:5.68

腎臓:4.40

下垂体:2.21

甲状腺:4.18

副腎:-

膵臓:3.54

乳腺:5.47

唾液腺:3.40

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.81

卵巣:4.71

精巣:5.38

心臓:4.36

骨格筋:3.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.44

肝臓:2.30

肺:6.83

膀胱:-

腎臓:5.12

下垂体:-

甲状腺:4.52

副腎:5.88

膵臓:-

乳腺:6.71

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001846
Gene ID	1284
Unigene ID	Hs.508716
Probe set ID	211964_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000134871
GTEx ID	ENSG00000134871

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009932
ラット[1]	NM_009932

染色体

13q34 [110,958,159 - 111,165,374]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001525	angiogenesis
GO:0007411	axon guidance
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0016525	negative regulation of angiogenesis
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005587	collagen type IV
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0005515	protein binding

collagen, type IV, alpha 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function