collagen, type IV, alpha 3 (Goodpasture antigen)

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同義遺伝子名

collagen, type IV, alpha 3 (Goodpasture antigen), Collagen alpha-3(IV) chain precursor, COL4A3, Goodpasture antigen

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:10.70

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:237.30

目:123.40

動脈:30

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:56.70

胸腺:25.80

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:2.96

小脳:2.85

脳幹:2.95

脳梁:2.82

松果体:-

末梢神経:2.91

脊柱:2.97

網膜:-

目:-

動脈:3.11

静脈:2.91

リンパ節:3.12

末梢血:-

脾臓:3.26

胸腺:2.97

骨髄:3.03

脂肪:3.01

骨:-

皮膚:3.03

CAGE

大脳:1.11

小脳:-

脳幹:1.50

脳梁:1.31

松果体:2.87

末梢神経:-

脊柱:1.88

網膜:-

目:-

動脈:2.64

静脈:1.89

リンパ節:2.05

末梢血:-

脾臓:2.14

胸腺:0.06

骨髄:-

脂肪:0.26

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.64

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.02

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:17.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:10.60

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:579.90

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:2.89

胎盤:2.88

前立腺:3

卵巣:2.92

精巣:2.84

心臓:3.03

骨格筋:3.11

食道:3.12

胃:2.91

腸:3.21

結腸:2.94

肝臓:2.92

肺:2.96

膀胱:-

腎臓:3.38

下垂体:3.41

甲状腺:3.20

副腎:3.44

膵臓:3.09

乳腺:2.92

唾液腺:2.95

CAGE

子宮:1.07

胎盤:0.24

前立腺:1.85

卵巣:1.31

精巣:1.20

心臓:2.39

骨格筋:2.46

食道:0.97

胃:-

腸:0.87

結腸:0.99

肝臓:0.26

肺:2.90

膀胱:1.35

腎臓:3.58

下垂体:2.94

甲状腺:2.80

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0.55

唾液腺:1.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.53

卵巣:0.41

精巣:0.62

心臓:0.71

骨格筋:0.46

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.03

肝臓:0.11

肺:1.51

膀胱:-

腎臓:3.42

下垂体:-

甲状腺:2.31

副腎:1.57

膵臓:-

乳腺:0.26

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000091
Gene ID	1285
Unigene ID	Hs.570065
Probe set ID	216893_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000169031
GTEx ID	ENSG00000169031

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_007734
ラット[1]	NM_001135759

染色体

2q36.3 [228,029,281 - 228,179,508]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006919	activation of caspase activity
GO:0007411	axon guidance
GO:0008015	blood circulation
GO:0007155	cell adhesion
GO:0008283	cell proliferation
GO:0007166	cell surface receptor linked signal transduction
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0032836	glomerular basement membrane development
GO:0016525	negative regulation of angiogenesis
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0007605	sensory perception of sound

Cellular Component

GO:0005604	basement membrane
GO:0005587	collagen type IV
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0005178	integrin binding
GO:0008191	metalloendopeptidase inhibitor activity
GO:0005515	protein binding
GO:0005198	structural molecule activity

collagen, type IV, alpha 3 (Goodpasture antigen)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function