collagen, type V, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type V, alpha 1, Collagen alpha-1(V) chain precursor, COL5A1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:24.90

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:245.40

脊柱:224.60

網膜:118.60

目:170.40

動脈:89.90

静脈:66.60

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:113.40

胸腺:-

骨髄:177.10

脂肪:242

骨:422.20

皮膚:110.40

GeneChip

大脳:4.05

小脳:4.18

脳幹:4.01

脳梁:4.22

松果体:-

末梢神経:5.85

脊柱:4.10

網膜:-

目:-

動脈:6.72

静脈:6.63

リンパ節:4.71

末梢血:-

脾臓:5.35

胸腺:4.41

骨髄:4.44

脂肪:6.42

骨:-

皮膚:5.94

CAGE

大脳:0.73

小脳:-

脳幹:1.28

脳梁:0.88

松果体:2.55

末梢神経:-

脊柱:1.34

網膜:-

目:-

動脈:4.16

静脈:3.37

リンパ節:2.31

末梢血:-

脾臓:2.49

胸腺:1.54

骨髄:-

脂肪:2.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.26

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.23

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.16

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:282.50

胎盤:94.70

前立腺:33.80

卵巣:186.30

精巣:43.30

心臓:383.20

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:67.80

肝臓:42.20

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:62.20

乳腺:120.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.69

胎盤:7.29

前立腺:5.62

卵巣:6.87

精巣:4.75

心臓:5.63

骨格筋:4.70

食道:5.58

胃:6.91

腸:7.06

結腸:6.44

肝臓:4.59

肺:5.75

膀胱:-

腎臓:4.38

下垂体:4.40

甲状腺:4.57

副腎:5.05

膵臓:4.69

乳腺:6.50

唾液腺:4.79

CAGE

子宮:4.82

胎盤:4.45

前立腺:3.76

卵巣:3.53

精巣:2.66

心臓:3.19

骨格筋:1.53

食道:3.12

胃:-

腸:2.77

結腸:3.58

肝臓:1.66

肺:3.07

膀胱:3.69

腎臓:2.00

下垂体:0.43

甲状腺:1.65

副腎:-

膵臓:1.87

乳腺:2.95

唾液腺:1.82

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.71

卵巣:4.03

精巣:2.95

心臓:1.31

骨格筋:0.30

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.47

肝臓:1.16

肺:2.10

膀胱:-

腎臓:1.84

下垂体:-

甲状腺:1.33

副腎:3.01

膵臓:-

乳腺:4.08

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000093
Gene ID	1289
Unigene ID	Hs.210283
Probe set ID	212489_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000130635
GTEx ID	ENSG00000130635

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_015734
ラット[1]	NM_134452

染色体

9q34.3 [137,533,620 - 137,736,686]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985	Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320	Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001791	Laminin G

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0001568	blood vessel development
GO:0007155	cell adhesion
GO:0016477	cell migration
GO:0032964	collagen biosynthetic process
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0048592	eye morphogenesis
GO:0043206	fibril organization
GO:0003007	heart morphogenesis
GO:0045112	integrin biosynthetic process
GO:0051128	regulation of cellular component organization
GO:0043588	skin development
GO:0035313	wound healing, spreading of epidermal cells

Cellular Component

GO:0005604	basement membrane
GO:0005588	collagen type V
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0008201	heparin binding
GO:0005178	integrin binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0048407	platelet-derived growth factor binding
GO:0043394	proteoglycan binding

collagen, type V, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function