collagen, type VI, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type VI, alpha 1, OPLL, COL6A1, Collagen alpha-1(VI) chain precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:33.20

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:398.70

脊柱:673.80

網膜:237.30

目:199.80

動脈:30

静脈:599.80

リンパ節:30.30

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:77.30

骨髄:236.20

脂肪:201.70

骨:563

皮膚:110.40

GeneChip

大脳:5.24

小脳:5.55

脳幹:5.36

脳梁:5.04

松果体:-

末梢神経:5.23

脊柱:4.94

網膜:-

目:-

動脈:6.09

静脈:5.92

リンパ節:5.04

末梢血:-

脾臓:4.97

胸腺:5.28

骨髄:5.09

脂肪:6.13

骨:-

皮膚:5.67

CAGE

大脳:3.74

小脳:-

脳幹:3.87

脳梁:3.64

松果体:3.48

末梢神経:-

脊柱:3.79

網膜:-

目:-

動脈:6.55

静脈:5.67

リンパ節:4.82

末梢血:-

脾臓:4.70

胸腺:4.04

骨髄:-

脂肪:6.28

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:6.02

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:7.30

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:355.40

胎盤:193.10

前立腺:56.30

卵巣:298.10

精巣:21.60

心臓:664.10

骨格筋:140.60

食道:342.80

胃:63.70

腸:226.80

結腸:169.60

肝臓:-

肺:312.80

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:203.10

膵臓:71.10

乳腺:241.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.55

胎盤:5.20

前立腺:5.60

卵巣:5.95

精巣:5.06

心臓:5.78

骨格筋:5.60

食道:5.26

胃:5.52

腸:5.94

結腸:5.90

肝臓:5.19

肺:5.33

膀胱:-

腎臓:5.42

下垂体:5.53

甲状腺:5.07

副腎:5.18

膵臓:5.71

乳腺:5.16

唾液腺:5.32

CAGE

子宮:6.61

胎盤:5.69

前立腺:6.07

卵巣:6.19

精巣:4.92

心臓:5.84

骨格筋:4.65

食道:5.95

胃:-

腸:5.05

結腸:5.98

肝臓:4.12

肺:5.22

膀胱:6.43

腎臓:4.14

下垂体:4.76

甲状腺:4.65

副腎:-

膵臓:4.39

乳腺:6.42

唾液腺:4.63

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:7.11

卵巣:7.16

精巣:5.96

心臓:4.49

骨格筋:3.81

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:7.08

肝臓:3.48

肺:6.05

膀胱:-

腎臓:3.99

下垂体:-

甲状腺:5.02

副腎:5.96

膵臓:-

乳腺:6.84

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001848
Gene ID	1291
Unigene ID	Hs.474053
Probe set ID	212937_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000142156
GTEx ID	ENSG00000142156

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009933
ラット[1]	NM_009933

染色体

21q22.3 [47,401,651 - 47,424,964]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0007411	axon guidance
GO:0007155	cell adhesion
GO:0071230	cellular response to amino acid stimulus
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0070208	protein heterotrimerization

GO:0005589	collagen type VI
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0043234	protein complex
GO:0042383	sarcolemma

collagen, type VI, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function