collagen, type VIII, alpha 1

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同義遺伝子名

Collagen alpha-1(VIII) chain precursor, COL8A1, collagen, type VIII, alpha 1, Endothelial collagen, MGC9568

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:2.71 小脳:2.68 脳幹:2.79 脳梁:2.72 松果体:- 末梢神経:3.22 脊柱:2.73 網膜:- 目:- 動脈:3.57 静脈:3.12 リンパ節:2.70 末梢血:- 脾臓:2.61 胸腺:2.39 骨髄:2.74 脂肪:2.81 骨:- 皮膚:2.81
CAGE 大脳:1.16 小脳:- 脳幹:1.55 脳梁:1.81 松果体:2.47 末梢神経:- 脊柱:2.32 網膜:- 目:- 動脈:5.87 静脈:3.00 リンパ節:0.97 末梢血:- 脾臓:1.29 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:3.30 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.44 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.35 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.63 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:2.72 胎盤:2.79 前立腺:2.76 卵巣:3.02 精巣:2.57 心臓:3.35 骨格筋:2.91 食道:2.79 胃:2.81 腸:2.85 結腸:2.88 肝臓:2.75 肺:2.93 膀胱:- 腎臓:2.66 下垂体:2.65 甲状腺:2.83 副腎:2.65 膵臓:2.91 乳腺:2.60 唾液腺:2.75
CAGE 子宮:2.78 胎盤:2.60 前立腺:3.53 卵巣:3.00 精巣:2.13 心臓:3.68 骨格筋:2.15 食道:3.61 胃:- 腸:1.29 結腸:2.76     肝臓:1.71    肺:4.49 膀胱:3.60 腎臓:3.12 下垂体:3.21 甲状腺:4.79 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:3.02 唾液腺:1.67
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.28 卵巣:1.70 精巣:1.90 心臓:2.18 骨格筋:0.99 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.83     肝臓:0.33        肺:3.36    膀胱:- 腎臓:1.89 下垂体:- 甲状腺:2.11 副腎:1.06 膵臓:- 乳腺:2.52 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020351
Gene ID 1295
Unigene ID -
Probe set ID 214587_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000144810
GTEx ID ENSG00000144810

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_007739
ラット[1]  NM_001107100

染色体

3q12.1  [99,357,319  -  99,518,070]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2029894
9438378
9705353
10666376
10731515
10823842
11689488
12107410
12477932
12482545
12782141
15489334
16189514
16344560
16713569
16936088
17721297
19060904
19913121
20379614
20385826
20628086
21139683
23455636
23512105
23533600
24144296

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001525  angiogenesis
GO:0048593  camera-type eye morphogenesis
GO:0007155  cell adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0050673  epithelial cell proliferation
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0010811  positive regulation of cell-substrate adhesion

Cellular Component

GO:0005604  basement membrane
GO:0005591  collagen type VIII
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region