collagen, type VIII, alpha 2

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同義遺伝子名

FLJ00201, PPCD2, FECD, Endothelial collagen, COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain precursor, MGC116970, MGC116972, PPCD, collagen, type VIII, alpha 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:7.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:355.90 目:105.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:64 皮膚:24
GeneChip 大脳:4.70 小脳:5.83 脳幹:4.94 脳梁:5.71 松果体:- 末梢神経:6.61 脊柱:5.75 網膜:- 目:- 動脈:6.48 静脈:6.77 リンパ節:5.32 末梢血:- 脾臓:5.55 胸腺:4.76 骨髄:4.76 脂肪:5.62 骨:- 皮膚:5.14
CAGE 大脳:0.53 小脳:- 脳幹:0.81 脳梁:1.21 松果体:0.21 末梢神経:- 脊柱:1.59 網膜:- 目:- 動脈:2.93 静脈:1.69 リンパ節:0.99 末梢血:- 脾臓:1.48 胸腺:0.64 骨髄:- 脂肪:0.96 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.66 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.18 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.25 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:- 前立腺:67.60 卵巣:37.30 精巣:4.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:279.80     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.44 胎盤:6.16 前立腺:5.10 卵巣:5.40 精巣:4.40 心臓:5.46 骨格筋:4.76 食道:5.53 胃:6 腸:5.15 結腸:5.50 肝臓:4.74 肺:5.21 膀胱:- 腎臓:4.48 下垂体:5.06 甲状腺:5.78 副腎:4.80 膵臓:5.22 乳腺:6.67 唾液腺:5.28
CAGE 子宮:1.16 胎盤:1.11 前立腺:1.51 卵巣:1.33 精巣:0.76 心臓:1.32 骨格筋:0.46 食道:1.44 胃:- 腸:0.33 結腸:0.77     肝臓:0    肺:1.04 膀胱:1.75 腎臓:0.27 下垂体:0.50 甲状腺:1.70 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:1.92 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.04 卵巣:2.36 精巣:2.13 心臓:0.48 骨格筋:0.55 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.59     肝臓:0.17        肺:1.52    膀胱:- 腎臓:0.46 下垂体:- 甲状腺:2.73 副腎:3.03 膵臓:- 乳腺:2.25 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005202
Gene ID 1296
Unigene ID Hs.353001
Probe set ID 221900_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000171812
GTEx ID ENSG00000171812

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_199473
ラット[1]  NM_199473

染色体

1p34.3  [36,560,837  -  36,590,821]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2019595
2029894
9438378
9705353
10686422
11689488
12477932
12782141
14702039
14990571
15015022
15175909
15851557
15914606
16303941
16908762
16936088
17471329
17721297
18024822
18464802
18502986
20144242
21139683
22020132
22814818
23110055
23291589
23608731

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001525  angiogenesis
GO:0048593  camera-type eye morphogenesis
GO:0016337  cell-cell adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0050673  epithelial cell proliferation
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005604  basement membrane
GO:0005581  collagen
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0030674  protein binding, bridging