collagen, type XI, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type XI, alpha 1, STL2, CO11A1, Collagen alpha-1(XI) chain precursor, COLL6, COL11A1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:1042.80

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:179.10

皮膚:105.60

GeneChip

大脳:4.60

小脳:3.30

脳幹:4.76

脳梁:4.63

松果体:-

末梢神経:5.72

脊柱:4.51

網膜:-

目:-

動脈:3.16

静脈:3.07

リンパ節:3.04

末梢血:-

脾臓:3.15

胸腺:3.03

骨髄:3.38

脂肪:3.06

骨:-

皮膚:3.47

CAGE

大脳:2.30

小脳:-

脳幹:2.20

脳梁:2.13

松果体:1.25

末梢神経:-

脊柱:2.78

網膜:-

目:-

動脈:1.57

静脈:0.18

リンパ節:0.17

末梢血:-

脾臓:1.69

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:1.12

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:21.90

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:-

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.31

胎盤:4.01

前立腺:3.11

卵巣:4.10

精巣:4.02

心臓:3.40

骨格筋:3.14

食道:3.07

胃:2.95

腸:4.37

結腸:2.98

肝臓:2.99

肺:2.87

膀胱:-

腎臓:3.03

下垂体:4.38

甲状腺:3.02

副腎:3.55

膵臓:3.18

乳腺:3.45

唾液腺:3.44

CAGE

子宮:0.81

胎盤:2.62

前立腺:0.33

卵巣:0.92

精巣:0.90

心臓:0.28

骨格筋:0.33

食道:0.26

胃:-

腸:0.27

結腸:0.21

肝臓:0

肺:0.64

膀胱:0.26

腎臓:0.08

下垂体:2.08

甲状腺:0.41

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0.90

唾液腺:1.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.26

精巣:0.16

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0

肺:0.04

膀胱:-

腎臓:0.04

下垂体:-

甲状腺:0.05

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:1.04

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001854
Gene ID	1301
Unigene ID	Hs.523446
Probe set ID	37892_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000060718
GTEx ID	ENSG00000060718

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007729
ラット[2]	NM_007729

染色体

1p21.1 [103,342,023 - 103,574,052]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985	Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320	Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001791	Laminin G

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001502	cartilage condensation
GO:0002063	chondrocyte development
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0050910	detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound
GO:0048704	embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0042472	inner ear morphogenesis
GO:0006029	proteoglycan metabolic process
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0055010	ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005592	collagen type XI
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0050840	extracellular matrix binding
GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0046872	metal ion binding
GO:0030674	protein binding, bridging

collagen, type XI, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function