collagen, type XI, alpha 2

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同義遺伝子名

collagen, type XI, alpha 2, DFNB53, PARP, HKE5, COL11A2, DFNA13, STL3, Collagen alpha-2(XI) chain precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:15.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:214.70

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:166.30

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:6.82

小脳:6.96

脳幹:6.82

脳梁:6.93

松果体:-

末梢神経:6.68

脊柱:6.65

網膜:-

目:-

動脈:6.68

静脈:7.01

リンパ節:6.62

末梢血:-

脾臓:6.48

胸腺:6.46

骨髄:6.82

脂肪:6.78

骨:-

皮膚:6.91

CAGE

大脳:0.78

小脳:-

脳幹:0.83

脳梁:1.33

松果体:0.55

末梢神経:-

脊柱:1.21

網膜:-

目:-

動脈:2.02

静脈:0

リンパ節:0.12

末梢血:-

脾臓:0.17

胸腺:0.37

骨髄:-

脂肪:0.26

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:8.70

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.56

胎盤:6.44

前立腺:6.27

卵巣:6.71

精巣:6.87

心臓:6.75

骨格筋:6.88

食道:6.62

胃:6.80

腸:6.79

結腸:6.68

肝臓:6.74

肺:6.72

膀胱:-

腎臓:6.67

下垂体:7.17

甲状腺:6.69

副腎:6.80

膵臓:7.18

乳腺:6.46

唾液腺:6.80

CAGE

子宮:0.13

胎盤:0.16

前立腺:0.08

卵巣:0.07

精巣:0.73

心臓:0.50

骨格筋:0.21

食道:0

胃:-

腸:0.53

結腸:0.04

肝臓:0.14

肺:0.31

膀胱:0.09

腎臓:0.15

下垂体:2.50

甲状腺:0.32

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0

副腎:0

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_080680
Gene ID	1302
Unigene ID	Hs.390171
Probe set ID	216993_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000204248 ENSG00000230930
GTEx ID	ENSG00000204248 ENSG00000230930

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009926
ラット[1]	NM_212528

染色体

6p21.32 [33,130,458 - 33,160,276]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_COX [33,052,091 - 33,081,908]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_SSTO [33,269,767 - 33,296,554]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_QBL [33,059,284 - 33,089,101]

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- -10kb から +10kb の範囲

HSCHR6_MHC_MCF [33,300,827 - 33,330,643]

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HSCHR6_MHC_DBB [33,108,368 - 33,138,186]

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HSCHR6_MHC_MANN [33,284,377 - 33,314,194]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985	Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320	Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001791	Laminin G

GO:0051216	cartilage development
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0060021	palate development
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0001501	skeletal system development
GO:0060023	soft palate development

GO:0005592	collagen type XI
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

GO:0030020	extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
GO:0046872	metal ion binding
GO:0030674	protein binding, bridging

collagen, type XI, alpha 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function