collagen, type XVII, alpha 1

同義遺伝子名

KIAA0204, BA16H23.2, Collagen alpha-1(XVII) chain, 180 kDa bullous pemphigoid antigen 2, BP180, LAD-1, Bullous pemphigoid antigen 2, BPAG2, collagen, type XVII, alpha 1, COL17A1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:2.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:111.70

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:64.40

骨髄:59

脂肪:-

骨:-

皮膚:2337.70

GeneChip

大脳:4.42

小脳:4.92

脳幹:4.47

脳梁:4.47

松果体:-

末梢神経:4.35

脊柱:4.31

網膜:-

目:-

動脈:4.65

静脈:4.73

リンパ節:4.94

末梢血:-

脾臓:4.18

胸腺:5.75

骨髄:6.42

脂肪:4.93

骨:-

皮膚:7.09

CAGE

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:0.13

脳梁:0.07

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:1.48

静脈:2.92

リンパ節:2.03

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:3.63

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.17

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.15

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.43

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:80.10

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:26

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:342.80

胃:-

腸:-

結腸:76.30

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.60

胎盤:6.75

前立腺:5.13

卵巣:4.48

精巣:5.35

心臓:4.60

骨格筋:4.53

食道:6.66

胃:4.57

腸:4.76

結腸:5.13

肝臓:4.29

肺:4.63

膀胱:-

腎臓:4.40

下垂体:4.59

甲状腺:4.64

副腎:4.40

膵臓:5.30

乳腺:6.18

唾液腺:5.54

CAGE

子宮:2.29

胎盤:5.27

前立腺:2.60

卵巣:0

精巣:0.48

心臓:0.03

骨格筋:0.25

食道:4.31

胃:-

腸:4.00

結腸:3.36

肝臓:0

肺:0.46

膀胱:1.56

腎臓:0.33

下垂体:0.62

甲状腺:1.72

副腎:-

膵臓:0

乳腺:2.34

唾液腺:3.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.83

卵巣:0.13

精巣:0.77

心臓:0.00

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.61

肝臓:0.00

肺:0.52

膀胱:-

腎臓:0.10

下垂体:-

甲状腺:0.88

副腎:0.32

膵臓:-

乳腺:2.96

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000494
Gene ID	1308
Unigene ID	Hs.117938
Probe set ID	204636_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000065618
GTEx ID	ENSG00000065618

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007732
ラット[1]	NM_001106366

染色体

10q25.1 [105,791,044 - 105,845,760]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0034329	cell junction assembly
GO:0007160	cell-matrix adhesion
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0008544	epidermis development
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0031581	hemidesmosome assembly

Cellular Component

GO:0005604	basement membrane
GO:0005911	cell-cell junction
GO:0005581	collagen
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region
GO:0030056	hemidesmosome
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515

protein binding

collagen, type XVII, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function