cleavage stimulation factor, 3' pre-RNA, subunit 1, 50kDa

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同義遺伝子名

Cleavage stimulation factor 50 kDa subunit, CstFp50, CstF-50, CSTF1, CF-1 50 kDa subunit, CSTF 50 kDa subunit

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:65.20 小脳:125.90 脳幹:- 脳梁:116.60 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:23.50 動脈:- 静脈:133.30 リンパ節:60.70 末梢血:109.30 脾臓:37.80 胸腺:51.50 骨髄:78.70 脂肪:40.30 骨:76.80 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:3.88 小脳:3.83 脳幹:3.86 脳梁:3.75 松果体:- 末梢神経:3.95 脊柱:3.90 網膜:- 目:- 動脈:3.88 静脈:3.82 リンパ節:4.08 末梢血:- 脾臓:4.10 胸腺:4.48 骨髄:3.97 脂肪:3.94 骨:- 皮膚:4.12
CAGE 大脳:2.96 小脳:- 脳幹:3.01 脳梁:3.14 松果体:3.50 末梢神経:- 脊柱:2.90 網膜:- 目:- 動脈:2.02 静脈:3.07 リンパ節:3.17 末梢血:- 脾臓:3.19 胸腺:3.70 骨髄:- 脂肪:3.15 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.75 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.14 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.99 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:118.50 胎盤:76.50 前立腺:101.40 卵巣:37.30 精巣:142.80 心臓:51.10 骨格筋:60.30 食道:- 胃:42.50 腸:97.20 結腸:42.40     肝臓:10.60        肺:24.40    膀胱:125.60 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:304.70 膵臓:26.70 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.16 胎盤:4.03 前立腺:4.65 卵巣:4.17 精巣:5.19 心臓:3.81 骨格筋:4.04 食道:4.14 胃:3.90 腸:3.93 結腸:3.85 肝臓:4.14 肺:3.72 膀胱:- 腎臓:3.96 下垂体:4.11 甲状腺:4.13 副腎:3.92 膵臓:3.82 乳腺:4.25 唾液腺:4.19
CAGE 子宮:3.22 胎盤:2.93 前立腺:3.15 卵巣:3.40 精巣:3.94 心臓:2.63 骨格筋:3.00 食道:3.06 胃:- 腸:2.81 結腸:2.79     肝臓:3.53    肺:2.79 膀胱:3.00 腎臓:3.28 下垂体:3.28 甲状腺:3.13 副腎:- 膵臓:3.23 乳腺:2.53 唾液腺:3.63
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.66 卵巣:2.39 精巣:3.72 心臓:1.97 骨格筋:0.72 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.22     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.70 下垂体:- 甲状腺:0.16 副腎:1.84 膵臓:- 乳腺:0.47 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001033521
Gene ID 1477
Unigene ID Hs.172865
Probe set ID 32723_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000101138
GTEx ID ENSG00000101138

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_024199
ラット[1]  NM_001013161

染色体

20q13.2  [54,967,427  -  54,979,518]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1358884
1741396
7590244
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9002523
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11278247
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18842000
19124506
19170196
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19625176
19692168
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20379614
21070969
21139048
21903422
21906983
22446626
23537643
24250222
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0006379  mRNA cleavage
GO:0006378  mRNA polyadenylation
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006396  RNA processing
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding