SIX homeobox 5

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同義遺伝子名

DM locus-associated homeodomain protein, DMAHP, Homeobox protein SIX5, SIX5, sine oculis homeobox homolog 5 (Drosophila), sine oculis homeobox (Drosophila) homolog 5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:4.63 小脳:4.88 脳幹:4.56 脳梁:4.60 松果体:- 末梢神経:4.31 脊柱:4.21 網膜:- 目:- 動脈:4.47 静脈:4.86 リンパ節:4.74 末梢血:- 脾臓:4.31 胸腺:4.34 骨髄:4.80 脂肪:4.67 骨:- 皮膚:4.56
CAGE 大脳:1.05 小脳:- 脳幹:1.37 脳梁:1.66 松果体:1.04 末梢神経:- 脊柱:1.81 網膜:- 目:- 動脈:3.08 静脈:2.22 リンパ節:1.86 末梢血:- 脾臓:1.76 胸腺:0.77 骨髄:- 脂肪:2.59 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.33 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.13 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.32 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:3.60 前立腺:- 卵巣:37.30 精巣:38.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.65 胎盤:4.44 前立腺:4.12 卵巣:4.73 精巣:4.18 心臓:4.92 骨格筋:4.79 食道:4.72 胃:4.62 腸:4.65 結腸:4.83 肝臓:4.79 肺:4.69 膀胱:- 腎臓:4.65 下垂体:4.61 甲状腺:4.58 副腎:4.83 膵臓:5.14 乳腺:4.51 唾液腺:5.03
CAGE 子宮:3.43 胎盤:2.48 前立腺:3.52 卵巣:3.51 精巣:2.17 心臓:2.74 骨格筋:1.93 食道:2.89 胃:- 腸:1.97 結腸:2.54     肝臓:2.55    肺:2.42 膀胱:3.17 腎臓:2.01 下垂体:1.75 甲状腺:3.19 副腎:- 膵臓:3.52 乳腺:2.95 唾液腺:3.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.18 卵巣:3.65 精巣:2.63 心臓:1.34 骨格筋:2.27 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.60     肝臓:1.36        肺:1.78    膀胱:- 腎臓:1.57 下垂体:- 甲状腺:2.72 副腎:1.82 膵臓:- 乳腺:2.45 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_175875
Gene ID 147912
Unigene ID Hs.433146
Probe set ID 217661_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000177045
GTEx ID ENSG00000177045

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011383
ラット[1]  NM_011383

染色体

19q13.32  [46,268,044  -  46,272,497]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8595416
9241282
9817928
9949207
10490620
10756185
10823141
11748221
11978764
12477932
12500905
14702039
15489334
16713569
17357085
18029348
19851296
20198315
20301554
21280147
22447252
22939629

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0002088  lens development in camera-type eye
GO:0008285  negative regulation of cell proliferation
GO:0007286  spermatid development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity